seq1 = pF1KB6874.tfa, 594 bp
seq2 = pF1KB6874/gi568815578r_45227267.tfa (gi568815578r:45227267_45448384), 221118 bp

>pF1KB6874 594
>gi568815578r:45227267_45448384 (Chr20)

(complement)

1-60  (100001-100060)   98% ->
61-199  (112465-112603)   100% ->
200-246  (115316-115362)   100% ->
247-445  (117821-118019)   100% ->
446-594  (120970-121118)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCCCGCCCGTCTGTTCGCGCTGCTGCTGCTCTTCGTAGGCGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCCCGCCCGTCTGTTCGCGCTGCTGCTGTTCTTCGTAGGCGGAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCGAGTCG         ATCCGAGAGACTGAGGTCATCGACCCCCAGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCCGAGTCGGTG...TAGATCCGAGAGACTGAGGTCATCGACCCCCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCTCCTAGAAGGCCGATACTTCTCCGGAGCCCTACCAGACGATGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112496 ACCTCCTAGAAGGCCGATACTTCTCCGGAGCCCTACCAGACGATGAGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTAGTGGGGCCCGGGCAGGAATCTGATGACTTTGAGCTGTCTGGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112546 GTAGTGGGGCCCGGGCAGGAATCTGATGACTTTGAGCTGTCTGGCTCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGATCTGG         ATGACTTGGAAGACTCCATGATCGGCCCTGAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 112596 AGATCTGGGTA...CAGATGACTTGGAAGACTCCATGATCGGCCCTGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGTCCATCCCTTG         GTGCCTCTAGATAACCATATCCCTGAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 115349 TTGTCCATCCCTTGGTA...CAGGTGCCTCTAGATAACCATATCCCTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AGGGCAGGGTCTGGGAGCCAAGTCCCCACCGAACCCAAGAAACTAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117848 AGGGCAGGGTCTGGGAGCCAAGTCCCCACCGAACCCAAGAAACTAGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAATGAGGTTATCCCCAAGAGAATCTCACCCGTTGAAGAGAGTGAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117898 GAATGAGGTTATCCCCAAGAGAATCTCACCCGTTGAAGAGAGTGAGGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGTCCAACAAGGTGTCAATGTCCAGCACTGTGCAGGGCAGCAACATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117948 TGTCCAACAAGGTGTCAATGTCCAGCACTGTGCAGGGCAGCAACATCTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGAGAACGGAGGTCCTGGCAG         CTCTGATTGTGGGTGGCAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 117998 GAGAGAACGGAGGTCCTGGCAGGTA...CAGCTCTGATTGTGGGTGGCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CGTGGGCATCCTCTTTGCCGTCTTCCTGATCCTACTGCTCATGTACCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120989 CGTGGGCATCCTCTTTGCCGTCTTCCTGATCCTACTGCTCATGTACCGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGAAGAAGAAGGATGAAGGCAGCTATGACCTGGGCAAGAAACCCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121039 TGAAGAAGAAGGATGAAGGCAGCTATGACCTGGGCAAGAAACCCATCTAC

    600     .    :    .    :    .    :
    565 AAGAAAGCCCCCACCAATGAGTTCTACGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 121089 AAGAAAGCCCCCACCAATGAGTTCTACGCG