seq1 = pF1KB6869.tfa, 537 bp
seq2 = pF1KB6869/gi568815586f_10209385.tfa (gi568815586f:10209385_10414790), 205406 bp

>pF1KB6869 537
>gi568815586f:10209385_10414790 (Chr12)

1-100  (99998-100096)   96% ->
101-163  (100242-100304)   100% ->
164-315  (102080-102231)   100% ->
316-419  (104026-104129)   100% ->
420-537  (105289-105406)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGTGTTTAAGACCACTCTGTGGAGGTTAATTTCTGGGACCTTAGG
         | -||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 CTA CAGTGTTTAAGACCACTCTGTGGAGGTTAATTTCTGGGACCTTAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATAATATGCCTTTCGTTGATGGCTACGTTGGGAATTTTGTTGAAAAATT
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100047 GATAATATGCCTTTCGTTGATGTCTACGTTGGGAATTTTGTTGAAAAATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          CTTTTACTAAACTGAGTATTGAGCCAGCATTTACTCCAGGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100097 GTA...TAGCTTTTACTAAACTGAGTATTGAGCCAGCATTTACTCCAGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCAACATAGAACTCCAGAAAG         ACTCTGACTGCTGTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100283 CCCAACATAGAACTCCAGAAAGGTA...CAGACTCTGACTGCTGTTCTTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCAAGAAAAATGGGTTGGGTACCGGTGCAACTGTTACTTCATTTCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102099 CCAAGAAAAATGGGTTGGGTACCGGTGCAACTGTTACTTCATTTCCAGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AACAGAAAACTTGGAACGAAAGTCGGCATCTCTGTGCTTCTCAGAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102149 AACAGAAAACTTGGAACGAAAGTCGGCATCTCTGTGCTTCTCAGAAATCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCCTGCTTCAGCTTCAAAACACAGATGAACTG         GATTTTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102199 AGCCTGCTTCAGCTTCAAAACACAGATGAACTGGCA...CAGGATTTTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAGCTCCAGTCAACAATTTTACTGGATTGGACTCTCTTACAGTGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104034 GAGCTCCAGTCAACAATTTTACTGGATTGGACTCTCTTACAGTGAGGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACACCGCCTGGTTGTGGGAGAATGGCTCTGCACTCTCCCAGTATCT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 104084 ACACCGCCTGGTTGTGGGAGAATGGCTCTGCACTCTCCCAGTATCTGTA.

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    420      ATTTCCATCATTTGAAACTTTTAATACAAAGAACTGCATAGCGTA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104134 ..CAGATTTCCATCATTTGAAACTTTTAATACAAAGAACTGCATAGCGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TAATCCAAATGGAAATGCTTTAGATGAATCCTGTGAAGATAAAAATCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105334 TAATCCAAATGGAAATGCTTTAGATGAATCCTGTGAAGATAAAAATCGTT

    550     .    :    .    :
    515 ATATCTGTAAGCAACAGCTCATT
        |||||||||||||||||||||||
 105384 ATATCTGTAAGCAACAGCTCATT