seq1 = pF1KB6866.tfa, 588 bp
seq2 = pF1KB6866/gi568815589r_35549851.tfa (gi568815589r:35549851_35750853), 201003 bp

>pF1KB6866 588
>gi568815589r:35549851_35750853 (Chr9)

(complement)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-236  (100217-100352)   100% ->
237-295  (100439-100497)   100% ->
296-357  (100609-100670)   100% ->
358-588  (100773-101003)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCAGGCTGACCCTCGGCTCAGAGCAGTGTGCTTGTGGACTCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCAGGCTGACCCTCGGCTCAGAGCAGTGTGCTTGTGGACTCTCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCTGCAGCCATGAGCAGAGGCGACAACTGCACGGATCTACTCGCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCTGCAGCCATGAGCAGAGGCGACAACTGCACGGATCTACTCGCACTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          GAATCCCCTCCATAACCCAGGCCTGGGGACTGTGGGTCCTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTG...CAGGAATCCCCTCCATAACCCAGGCCTGGGGACTGTGGGTCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTAGGGGCTGTGACGCTGCTATTTCTCATCTCGCTGGCTGCACACTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100258 TTAGGGGCTGTGACGCTGCTATTTCTCATCTCGCTGGCTGCACACTTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAGTGGACCAGGGGCCGGAGCAGGAGCCATCCGGGGCAGGGACG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100308 CCAGTGGACCAGGGGCCGGAGCAGGAGCCATCCGGGGCAGGGACGGTG..

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    237     CTCTGGAGAGTCTGTGGAAGAGGTCCCGCTGTATGGGAACCTGCAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100358 .CAGCTCTGGAGAGTCTGTGGAAGAGGTCCCGCTGTATGGGAACCTGCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATCTACAGACAG         GACGGCTGTCTCAAGACCCAGAGCCAGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100485 TATCTACAGACAGGTA...CAGGACGGCTGTCTCAAGACCCAGAGCCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCAGCAGGATCCAACTCTTGGAGGCCCTGCCAGG         GCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100637 CCAGCAGGATCCAACTCTTGGAGGCCCTGCCAGGGTG...CAGGCTGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGGAGGTGATGTGCTATACCAGCCTGCAGCTGCGGCCTCCTCAGGGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100780 AGGAGGTGATGTGCTATACCAGCCTGCAGCTGCGGCCTCCTCAGGGTCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATCCCCGGTCCTGGAACCCCCGTCAAGTACTCGGAGGTGGTGCTGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100830 ATCCCCGGTCCTGGAACCCCCGTCAAGTACTCGGAGGTGGTGCTGGACTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGAGCCAAAGTCCCAGGCCTCGGGCCCCGAGCCGGAGCTCTATGCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100880 TGAGCCAAAGTCCCAGGCCTCGGGCCCCGAGCCGGAGCTCTATGCCTCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TATGTGCCCAGACCCGCAGGGCCCGGGCCTCCTTCCCGGATCAGGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100930 TATGTGCCCAGACCCGCAGGGCCCGGGCCTCCTTCCCGGATCAGGCCTAT

    600     .    :    .    :
    565 GCCAACAGCCAGCCTGCAGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||
 100980 GCCAACAGCCAGCCTGCAGCCAGC