seq1 = pF1KB6858.tfa, 582 bp
seq2 = pF1KB6858/gi568815588r_131868527.tfa (gi568815588r:131868527_132081806), 213280 bp

>pF1KB6858 582
>gi568815588r:131868527_132081806 (Chr10)

(complement)

1-46  (100001-100046)   100% ->
47-197  (107864-108014)   100% ->
198-282  (108689-108773)   100% ->
283-389  (110837-110943)   100% ->
390-539  (111020-111169)   100% ->
540-582  (113238-113280)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGCAGAACGGAGCGCCCGGGATGCAGGAGGAGAGCCTGCAGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100001 ATGTCGCAGAACGGAGCGCCCGGGATGCAGGAGGAGAGCCTGCAGGGTG.

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     47      GCTCCTGGGTAGAACTGCACTTCAGCAATAATGGGAACGGGGGCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ..CAGGCTCCTGGGTAGAACTGCACTTCAGCAATAATGGGAACGGGGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCGTTCCAGCCTCGGTTTCTATTTATAATGGAGACATGGAAAAAATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107909 GCGTTCCAGCCTCGGTTTCTATTTATAATGGAGACATGGAAAAAATACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGACGCACAGCATGAGTCTGGACGGAGTAGCTCCAAGAGCTCTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107959 CTGGACGCACAGCATGAGTCTGGACGGAGTAGCTCCAAGAGCTCTCACTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGACAG         CCCACCTCGCTCGCAGACACCACAAGATACCAACA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108009 TGACAGGTA...AAGCCCACCTCGCTCGCAGACACCACAAGATACCAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAGCTTCTGAAACAGATACCCATAGCATTGGAGAGAAAAACAGCTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108724 GAGCTTCTGAAACAGATACCCATAGCATTGGAGAGAAAAACAGCTCACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283          TCTGAGGAAGATGATATTGAAAGAAGGAAAGAAGTTGAAAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108774 GTA...TAGTCTGAGGAAGATGATATTGAAAGAAGGAAAGAAGTTGAAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATCTTGAAGAAAAACTCAGATTGGATATGGGATTGGTCAAGTCGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110878 CATCTTGAAGAAAAACTCAGATTGGATATGGGATTGGTCAAGTCGGCCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAAATATTCCCCCCAA         GGAGTTCCTCTTTAAACACCCGAAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 110928 AAAATATTCCCCCCAAGTG...CAGGGAGTTCCTCTTTAAACACCCGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CGCACGGCCACCCTCAGCATGAGGAACACGAGCGTCATGAAGAAAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111045 CGCACGGCCACCCTCAGCATGAGGAACACGAGCGTCATGAAGAAAGGGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CATATTCTCTGCAGAATTTCTGAAAGTTTTCCTTCCATCTCTGCTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111095 CATATTCTCTGCAGAATTTCTGAAAGTTTTCCTTCCATCTCTGCTGCTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTCATTTGCTGGCCATCGGATTGGG         GATCTATATTGGAAGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 111145 CTCATTTGCTGGCCATCGGATTGGGGTA...AAGGATCTATATTGGAAGG

    600     .    :    .    :    .
    556 CGTCTGACAACCTCCACCAGCACCTTT
        |||||||||||||||||||||||||||
 113254 CGTCTGACAACCTCCACCAGCACCTTT