seq1 = pF1KB6857.tfa, 537 bp
seq2 = pF1KB6857/gi568815590f_79536801.tfa (gi568815590f:79536801_79764871), 228071 bp

>pF1KB6857 537
>gi568815590f:79536801_79764871 (Chr8)

1-19  (74396-74414)   100% ->
20-115  (100002-100097)   100% ->
116-288  (104578-104750)   100% ->
289-480  (118071-118262)   100% ->
481-537  (128015-128071)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTAAAACAGCAATGG         CCTACAAGGAAAAAATGAAGGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  74396 ATGGCTAAAACAGCAATGGGTA...CAGCCTACAAGGAAAAAATGAAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCTGTCCATGCTGTCACTGATCTGCTCTTGCTTTTACCCGGAACCTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100024 GCTGTCCATGCTGTCACTGATCTGCTCTTGCTTTTACCCGGAACCTCGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACATCAACATCTATACTTACGATG         ATATGGAAGTGAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100074 ACATCAACATCTATACTTACGATGGTG...CAGATATGGAAGTGAAGCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATCAACAAACGTGCCTCTGGCCAGGCTTTTGAGCTGATCTTGAAGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104595 ATCAACAAACGTGCCTCTGGCCAGGCTTTTGAGCTGATCTTGAAGCCACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ATCTCCTATCTCAGAAGCCCCACGAACTTTAGCTTCTCCAAAGAAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104645 ATCTCCTATCTCAGAAGCCCCACGAACTTTAGCTTCTCCAAAGAAGAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACCTGTCCCTGGAGGAGATCCAGAAGAAACTGGAGGCTGCAGAGGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104695 ACCTGTCCCTGGAGGAGATCCAGAAGAAACTGGAGGCTGCAGAGGAAAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGAAAG         TCTCAGGAGGCCCAGGTGCTGAAACAATTGGCAGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104745 AGAAAGGTA...CAGTCTCAGGAGGCCCAGGTGCTGAAACAATTGGCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAAGAGGGAACACGAGCGAGAAGTCCTTCAGAAGGCTTTGGAGGAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118106 GAAGAGGGAACACGAGCGAGAAGTCCTTCAGAAGGCTTTGGAGGAGAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACAACTTCAGCAAGATGGCGGAGGAAAAGCTGATCCTGAAAATGGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118156 ACAACTTCAGCAAGATGGCGGAGGAAAAGCTGATCCTGAAAATGGAACAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATTAAGGAAAACCGTGAGGCTAATCTAGCTGCTATTATTGAACGTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118206 ATTAAGGAAAACCGTGAGGCTAATCTAGCTGCTATTATTGAACGTCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGAAAAG         GAGAGGCATGCTGCGGAGGTGCGCAGGAACAAGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118256 GGAAAAGGTA...TAGGAGAGGCATGCTGCGGAGGTGCGCAGGAACAAGG

    550     .    :    .    :
    515 AACTCCAGGTTGAACTGTCTGGC
        |||||||||||||||||||||||
 128049 AACTCCAGGTTGAACTGTCTGGC