seq1 = pF1KB6855.tfa, 534 bp
seq2 = pF1KB6855/gi568815597r_206668639.tfa (gi568815597r:206668639_206872435), 203797 bp

>pF1KB6855 534
>gi568815597r:206668639_206872435 (Chr1)

(complement)

1-165  (100001-100165)   100% ->
166-225  (101021-101080)   100% ->
226-378  (101377-101529)   100% ->
379-444  (102542-102607)   100% ->
445-534  (103708-103797)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACAGCTCAGCACTGCTCTGTTGCCTGGTCCTCCTGACTGGGGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACAGCTCAGCACTGCTCTGTTGCCTGGTCCTCCTGACTGGGGTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCAGCCCAGGCCAGGGCACCCAGTCTGAGAACAGCTGCACCCACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCAGCCCAGGCCAGGGCACCCAGTCTGAGAACAGCTGCACCCACTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGGCAACCTGCCTAACATGCTTCGAGATCTCCGAGATGCCTTCAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGGCAACCTGCCTAACATGCTTCGAGATCTCCGAGATGCCTTCAGCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGAAGACTTTCTTT         CAAATGAAGGATCAGCTGGACAACTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGAAGACTTTCTTTGTG...CAGCAAATGAAGGATCAGCTGGACAACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTTGTTAAAGGAGTCCTTGCTGGAGGACTTTAAG         GGTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101047 GTTGTTAAAGGAGTCCTTGCTGGAGGACTTTAAGGTG...TAGGGTTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGGTTGCCAAGCCTTGTCTGAGATGATCCAGTTTTACCTGGAGGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101384 TGGGTTGCCAAGCCTTGTCTGAGATGATCCAGTTTTACCTGGAGGAGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATGCCCCAAGCTGAGAACCAAGACCCAGACATCAAGGCGCATGTGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101434 ATGCCCCAAGCTGAGAACCAAGACCCAGACATCAAGGCGCATGTGAACTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGGGGGAGAACCTGAAGACCCTCAGGCTGAGGCTACGGCGCTGT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 101484 CCTGGGGGAGAACCTGAAGACCCTCAGGCTGAGGCTACGGCGCTGTGTA.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    379      CATCGATTTCTTCCCTGTGAAAACAAGAGCAAGGCCGTGGAGCAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101534 ..CAGCATCGATTTCTTCCCTGTGAAAACAAGAGCAAGGCCGTGGAGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGAAGAATGCCTTTAATAAG         CTCCAAGAGAAAGGCATCTA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 102587 GTGAAGAATGCCTTTAATAAGGTG...CAGCTCCAAGAGAAAGGCATCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAAAGCCATGAGTGAGTTTGACATCTTCATCAACTACATAGAAGCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103728 CAAAGCCATGAGTGAGTTTGACATCTTCATCAACTACATAGAAGCCTACA

    550     .    :    .    :
    515 TGACAATGAAGATACGAAAC
        ||||||||||||||||||||
 103778 TGACAATGAAGATACGAAAC