seq1 = pF1KB6850.tfa, 582 bp
seq2 = pF1KB6850/gi568815586r_101913111.tfa (gi568815586r:101913111_102161962), 248852 bp

>pF1KB6850 582
>gi568815586r:101913111_102161962 (Chr12)

(complement)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-150  (100617-100715)   100% ->
151-216  (115844-115909)   100% ->
217-324  (117751-117858)   100% ->
325-435  (121985-122095)   100% ->
436-500  (135925-135989)   100% ->
501-582  (148771-148852)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGAGGACGGGCTTCCTCTCATGGGGTCAGGCATAGACCTGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGAGGACGGGCTTCCTCTCATGGGGTCAGGCATAGACCTGACCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         GTGCCAGCTATTCAACAGAAAAGAACGGTGGCTTTTCTAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTT...CAGGTGCCAGCTATTCAACAGAAAAGAACGGTGGCTTTTCTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCAATTTGTGGTGCACACTGTACAGTTCCTCAACCGCTTTTCTACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100657 ACCAATTTGTGGTGCACACTGTACAGTTCCTCAACCGCTTTTCTACAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGTGAGGAG         AAACTGGCAGACCTTTCACTTCGTATCCAACA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100707 TGTGAGGAGGTA...CAGAAACTGGCAGACCTTTCACTTCGTATCCAACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AATTGAAACAACTCTCAATATTTTAGATGCAAAG         TTGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 115876 AATTGAAACAACTCTCAATATTTTAGATGCAAAGGTT...CAGTTGTCAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CTATCCCAGGCCTAGATGATGTCACAGTTGAAGTATCTCCTTTAAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117758 CTATCCCAGGCCTAGATGATGTCACAGTTGAAGTATCTCCTTTAAATGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACCAGTGTCACAAATGGAGCACATCCTGAAGCCACTTCAGAGCAACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117808 ACCAGTGTCACAAATGGAGCACATCCTGAAGCCACTTCAGAGCAACCACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 G         CAGAACAGTACACAAGACTCTGGACTACAGGAAAGTGAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117858 GGTA...CAGCAGAACAGTACACAAGACTCTGGACTACAGGAAAGTGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TATCAGCAGAAAATATCTTAACTGTAGCCAAGGATCCAAGATATGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122025 TATCAGCAGAAAATATCTTAACTGTAGCCAAGGATCCAAGATATGCCAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TATCTCAAAATGGTTCAAGTG         GGTGTACCAGTGATGGCAAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 122075 TATCTCAAAATGGTTCAAGTGGTA...TAGGGTGTACCAGTGATGGCAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AAGAAACAAAATGATATCAGAAGGACTAGACCCAGATCTTCTTGA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 135945 AAGAAACAAAATGATATCAGAAGGACTAGACCCAGATCTTCTTGAGTA..

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501     GAGGCCAGATGCTCCAGTGCCTGATGGCGAAAGTGAGAAAACTGTA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135995 .TAGGAGGCCAGATGCTCCAGTGCCTGATGGCGAAAGTGAGAAAACTGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .
    547 GAAGAAAGTTCAGATAGCGAATCTTCTTTTAGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148817 GAAGAAAGTTCAGATAGCGAATCTTCTTTTAGTGAT