seq1 = pF1KB6845.tfa, 525 bp
seq2 = pF1KB6845/gi568815596r_79057229.tfa (gi568815596r:79057229_79259405), 202177 bp

>pF1KB6845 525
>gi568815596r:79057229_79259405 (Chr2)

(complement)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-195  (100637-100755)   100% ->
196-333  (100943-101080)   100% ->
334-460  (101708-101834)   100% ->
461-525  (102113-102177)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCCTCCCATGGCCCTGCCCAGTGTATCTTGGATGCTGCTTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCCTCCCATGGCCCTGCCCAGTGTATCTTGGATGCTGCTTTCCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCATGCTGCTGTCTCAGGTTCAAG         GTGAAGAACCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 CCTCATGCTGCTGTCTCAGGTTCAAGGTG...CAGGTGAAGAACCCCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGAACTGCCCTCTGCACGGATCCGCTGTCCCAAAGGCTCCAAGGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100652 GGGAACTGCCCTCTGCACGGATCCGCTGTCCCAAAGGCTCCAAGGCCTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCTCCCACTGCTATGCCTTGTTTTTGTCACCAAAATCCTGGACAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100702 GGCTCCCACTGCTATGCCTTGTTTTTGTCACCAAAATCCTGGACAGATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAT         CTGGCCTGCCAGAAGCGGCCCTCTGGAAACCTGGTGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100752 AGATGTG...AAGCTGGCCTGCCAGAAGCGGCCCTCTGGAAACCTGGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGTGCTCAGTGGGGCTGAGGGATCCTTCGTGTCCTCCCTGGTGAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100980 CTGTGCTCAGTGGGGCTGAGGGATCCTTCGTGTCCTCCCTGGTGAAGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATTGGTAACAGCTACTCATACGTCTGGATTGGGCTCCATGACCCCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101030 ATTGGTAACAGCTACTCATACGTCTGGATTGGGCTCCATGACCCCACACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 G         GGCACCGAGCCCAATGGAGAAGGTTGGGAGTGGAGTAGCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101080 GGTG...CAGGGCACCGAGCCCAATGGAGAAGGTTGGGAGTGGAGTAGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTGATGTGATGAATTACTTTGCATGGGAGAGAAATCCCTCCACCATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101748 GTGATGTGATGAATTACTTTGCATGGGAGAGAAATCCCTCCACCATCTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGCCCCGGCCACTGTGCGAGCCTGTCGAGAAGCACAG         CATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101798 AGCCCCGGCCACTGTGCGAGCCTGTCGAGAAGCACAGGTA...CAGCATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCTGAGGTGGAAAGATTATAACTGTAATGTGAGGTTACCCTATGTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102117 TCTGAGGTGGAAAGATTATAACTGTAATGTGAGGTTACCCTATGTCTGCA

    550     .    :
    515 AGTTCACTGAC
        |||||||||||
 102167 AGTTCACTGAC