seq1 = pF1KB6843.tfa, 525 bp
seq2 = pF1KB6843/gi568815587r_6582121.tfa (gi568815587r:6582121_6783296), 201176 bp

>pF1KB6843 525
>gi568815587r:6582121_6783296 (Chr11)

(complement)

1-174  (100001-100174)   100% ->
175-243  (100482-100550)   100% ->
244-525  (100895-101176)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGGCTGTCGGTCGCTGCAGCGATCTCCCATGGCCGCGTATTTCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGGCTGTCGGTCGCTGCAGCGATCTCCCATGGCCGCGTATTTCGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATGGGCCTCGGTCCCGAGTCCCGCATCCATCTGTTGCGGAACTTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATGGGCCTCGGTCCCGAGTCCCGCATCCATCTGTTGCGGAACTTGCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGGGCTGGTGCGGCACGAACGCATCGAGGCACCATGGGCGCGTGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGGGCTGGTGCGGCACGAACGCATCGAGGCACCATGGGCGCGTGTGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAATGAGGGGCTACGCGGAGAAG         CTCATCGACTATGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100151 GAAATGAGGGGCTACGCGGAGAAGGTG...CAGCTCATCGACTATGGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGGGAGACACTAACGAACGAGCCATGCGCATGGCTGACTTCTGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100499 GCTGGGAGACACTAACGAACGAGCCATGCGCATGGCTGACTTCTGGCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CA         GAGAAGGATTTGATCCCAAAGCTGTTTCAAGTACTGGCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100549 CAGTG...TAGGAGAAGGATTTGATCCCAAAGCTGTTTCAAGTACTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCTCGGTACAAAGATCAAACTGGGGGCTACACAAGAATGCTGCAGATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100934 CCTCGGTACAAAGATCAAACTGGGGGCTACACAAGAATGCTGCAGATCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAATCGGAGTTTGGATCGGGCCAAGATGGCAGTGATCGAGTATAAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100984 AAATCGGAGTTTGGATCGGGCCAAGATGGCAGTGATCGAGTATAAAGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATTGCCTCCCACCCCTGCCTCTGCCTCGCAGAGACAGCCACCTTACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101034 ATTGCCTCCCACCCCTGCCTCTGCCTCGCAGAGACAGCCACCTTACACTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTAAACCAGCTGCTGCAGGGTTTGCGGCAGGACCTCAGGCAAAGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101084 CTAAACCAGCTGCTGCAGGGTTTGCGGCAGGACCTCAGGCAAAGCCAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGCAAGCAACCACAGCTCCCACACAGCTCAAACACCAGGGATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101134 AGCAAGCAACCACAGCTCCCACACAGCTCAAACACCAGGGATT