seq1 = pF1KB6841.tfa, 516 bp
seq2 = pF1KB6841/gi568815586f_107675219.tfa (gi568815586f:107675219_107875734), 200516 bp

>pF1KB6841 516
>gi568815586f:107675219_107875734 (Chr12)

1-516  (100001-100516)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACGCGTAAACCGGCGGAACGGCTGGCCTTGCCATACTCGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGACGCGTAAACCGGCGGAACGGCTGGCCTTGCCATACTCGCTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCGCGCCCCTGGGCGTTCCGGGGACCCTGCCCGGACTCCCGCGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCGCGCCCCTGGGCGTTCCGGGGACCCTGCCCGGACTCCCGCGGAGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCCCCTCAGGGTCGCCCTGCGTCTGGACGCCGCGTGCTGGGAGTGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCCCCTCAGGGTCGCCCTGCGTCTGGACGCCGCGTGCTGGGAGTGGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCAGCGGCTGCGCACGGGGATGGCAGTACTTGCCCGTGCCGCTGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCAGCGGCTGCGCACGGGGATGGCAGTACTTGCCCGTGCCGCTGGACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCCTTCGAGCCCGCCTTCCTCCGCAAGCGCAACGAGCGCGAGCGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCCTTCGAGCCCGCCTTCCTCCGCAAGCGCAACGAGCGCGAGCGGCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGTGCGCTGCGTGAACGAGGGCTATGCGCGCCTCCGAGACCACCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGTGCGCTGCGTGAACGAGGGCTATGCGCGCCTCCGAGACCACCTGCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGGGAGCTGGCAGACAAGCGCCTCAGCAAAGTGGAGACGCTCCGCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGGGAGCTGGCAGACAAGCGCCTCAGCAAAGTGGAGACGCTCCGCGCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATCGACTACATCAAGCACCTGCAGGAGCTGCTGGAGCGCCAGGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATCGACTACATCAAGCACCTGCAGGAGCTGCTGGAGCGCCAGGCCTGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCTCGAGGGCGCGGCCGGCGCCGTCCCCCAGCGCAGGGCGGAATGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCTCGAGGGCGCGGCCGGCGCCGTCCCCCAGCGCAGGGCGGAATGCAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCGACGGGGAGTCCAAGGCCTCTTCGGCGCCTTCGCCCAGCAGCGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCGACGGGGAGTCCAAGGCCTCTTCGGCGCCTTCGCCCAGCAGCGAGCC

    500     .    :    .
    501 CGAGGAGGGGGGCAGC
        ||||||||||||||||
 100501 CGAGGAGGGGGGCAGC