seq1 = pF1KB6835.tfa, 510 bp
seq2 = pF1KB6835/gi568815586f_85774404.tfa (gi568815586f:85774404_85982372), 207969 bp

>pF1KB6835 510
>gi568815586f:85774404_85982372 (Chr12)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-135  (102237-102298)   100% ->
136-360  (103942-104166)   100% ->
361-510  (107820-107969)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGCAGGAATGAAAATCCAGCTTGTATGCATGCTACTCCTGGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGCAGGAATGAAAATCCAGCTTGTATGCATGCTACTCCTGGCTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCTCCTGGAGTCTGTGCTCAG         ATTCAGAAGAGGAAATGA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 CAGCTCCTGGAGTCTGTGCTCAGGTA...CAGATTCAGAAGAGGAAATGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGCATTAGAAGCAGATTTCTTGACCAATATGCATACATCAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102255 AAGCATTAGAAGCAGATTTCTTGACCAATATGCATACATCAAAGGTA...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    136    ATTAGTAAAGCACATGTTCCCTCTTGGAAGATGACTCTGCTAAATGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103939 CAGATTAGTAAAGCACATGTTCCCTCTTGGAAGATGACTCTGCTAAATGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTGCAGTCTTGTAAATAATTTGAACAGCCCAGCTGAGGAAACAGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103989 TTGCAGTCTTGTAAATAATTTGAACAGCCCAGCTGAGGAAACAGGAGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTCATGAAGAGGAGCTTGTTGCAAGAAGGAAACTTCCTACTGCTTTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104039 TTCATGAAGAGGAGCTTGTTGCAAGAAGGAAACTTCCTACTGCTTTAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCTTTAGCTTGGAAGCAATGTTGACAATATACCAGCTCCACAAAATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104089 GGCTTTAGCTTGGAAGCAATGTTGACAATATACCAGCTCCACAAAATCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCACAGCAGGGCTTTTCAACACTGGGAG         TTAATCCAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 104139 TCACAGCAGGGCTTTTCAACACTGGGAGGTA...CAGTTAATCCAGGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATATTCTTGATACTGGAAATGACAAAAATGGAAAGGAAGAAGTCATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107833 ATATTCTTGATACTGGAAATGACAAAAATGGAAAGGAAGAAGTCATAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGAAAAATTCCTTATATTCTGAAACGGCAGCTGTATGAGAATAAACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107883 AGAAAAATTCCTTATATTCTGAAACGGCAGCTGTATGAGAATAAACCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .
    474 AAGACCCTACATACTCAAAAGAGATTCTTACTATTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107933 AAGACCCTACATACTCAAAAGAGATTCTTACTATTAC