seq1 = pF1KB6833.tfa, 507 bp
seq2 = pF1KB6833/gi568815582r_1670652.tfa (gi568815582r:1670652_1871534), 200883 bp

>pF1KB6833 507
>gi568815582r:1670652_1871534 (Chr16)

(complement)

1-46  (100001-100046)   100% ->
47-177  (100125-100255)   100% ->
178-279  (100364-100465)   100% ->
280-392  (100542-100654)   99% ->
393-507  (100769-100883)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCTGCCTGGTGCTGACCATCTTCGCTAACCTCTTCCCCGCGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100001 ATGATCTGCCTGGTGCTGACCATCTTCGCTAACCTCTTCCCCGCGGGTG.

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     47      CCTGCACCGGCGCACACGAACGCACCTTCCTGGCCGTGAAGCCGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ..CAGCCTGCACCGGCGCACACGAACGCACCTTCCTGGCCGTGAAGCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACGGCGTGCAGCGGCGGCTGGTGGGCGAGATTGTGCGGCGCTTCGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100170 ACGGCGTGCAGCGGCGGCTGGTGGGCGAGATTGTGCGGCGCTTCGAGAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGGGCTTCAAGTTGGTGGCGCTGAAGCTGGTGCAG         GCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100220 AAGGGCTTCAAGTTGGTGGCGCTGAAGCTGGTGCAGGTG...CAGGCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGAGGAGCTGCTGCGTGAGCACTACGCCGAGCTGCGTGAACGCCCGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100369 CGAGGAGCTGCTGCGTGAGCACTACGCCGAGCTGCGTGAACGCCCGTTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACGGCCGCCTTGTCAAGTATATGGCCTCCGGGCCGGTGGTGGCCATG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100419 ACGGCCGCCTTGTCAAGTATATGGCCTCCGGGCCGGTGGTGGCCATGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    280       GTTTGGCAGGGGCTGGACGTGGTGCGCACCTCGCGGGCGCTCAT
        ...>>>|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100469 ...CAGGTATGGCAGGGGCTGGACGTGGTGCGCACCTCGCGGGCGCTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGGAGCCACGAACCCGGCCGACGCCCCGCCCGGCACCATCCGCGGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100586 CGGAGCCACGAACCCGGCCGACGCCCCGCCCGGCACCATCCGCGGGGATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCTGCATCGAGGTTGGCAA         GAACCTGATTCACGGCAGCGAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100636 TCTGCATCGAGGTTGGCAAGTA...CAGGAACCTGATTCACGGCAGCGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TCGGTGGAGAGTGCCCGCCGCGAGATCGCTCTCTGGTTCCGCGCAGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100791 TCGGTGGAGAGTGCCCGCCGCGAGATCGCTCTCTGGTTCCGCGCAGACGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCTCCTCTGCTGGGAGGACAGCGCTGGGCACTGGCTGTATGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100841 GCTCCTCTGCTGGGAGGACAGCGCTGGGCACTGGCTGTATGAG