seq1 = pF1KB6832.tfa, 567 bp
seq2 = pF1KB6832/gi568815597f_7862786.tfa (gi568815597f:7862786_8085051), 222266 bp

>pF1KB6832 567
>gi568815597f:7862786_8085051 (Chr1)

1-90  (100001-100090)   100% ->
91-192  (102539-102640)   100% ->
193-252  (106560-106619)   100% ->
253-322  (108109-108178)   100% ->
323-409  (114867-114953)   100% ->
410-567  (122109-122266)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCCAAAAGAGCTCTGGTCATCCTGGCTAAAGGAGCAGAGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCCAAAAGAGCTCTGGTCATCCTGGCTAAAGGAGCAGAGGAAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGACGGTCATCCCTGTAGATGTCATGAGGCGAGCTGGG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100051 GGAGACGGTCATCCCTGTAGATGTCATGAGGCGAGCTGGGGTA...TAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTAAGGTCACCGTTGCAGGCCTGGCTGGAAAAGACCCAGTACAGTGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102540 TTAAGGTCACCGTTGCAGGCCTGGCTGGAAAAGACCCAGTACAGTGTAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGTGATGTGGTCATTTGTCCTGATGCCAGCCTTGAAGATGCAAAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102590 CGTGATGTGGTCATTTGTCCTGATGCCAGCCTTGAAGATGCAAAAAAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 G         GGACCATATGATGTGGTGGTTCTACCAGGAGGTAATCTGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102640 GGTT...CAGGGACCATATGATGTGGTGGTTCTACCAGGAGGTAATCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCGCACAGAATTTATCTGAG         TCTGCTGCTGTGAAGGAGATA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106600 GCGCACAGAATTTATCTGAGGTA...TAGTCTGCTGCTGTGAAGGAGATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGAAGGAGCAGGAAAACCGGAAGGGCCTGATAGCCGCCATCTGTGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 108130 CTGAAGGAGCAGGAAAACCGGAAGGGCCTGATAGCCGCCATCTGTGCAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    323         GTCCTACTGCTCTGTTGGCTCATGAAATAGGTTTTGGAAGTA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108180 TG...TAGGTCCTACTGCTCTGTTGGCTCATGAAATAGGTTTTGGAAGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAGTTACAACACACCCTCTTGCTAAAGACAAAATGATGAATGGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 114909 AAGTTACAACACACCCTCTTGCTAAAGACAAAATGATGAATGGAGGTA..

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    410     GTCATTACACCTACTCTGAGAATCGTGTGGAAAAAGACGGCCTGAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114959 .CAGGTCATTACACCTACTCTGAGAATCGTGTGGAAAAAGACGGCCTGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TCTTACAAGCCGGGGGCCTGGGACCAGCTTCGAGTTTGCGCTTGCAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122155 TCTTACAAGCCGGGGGCCTGGGACCAGCTTCGAGTTTGCGCTTGCAATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTGAAGCCCTGAATGGCAAGGAGGTGGCGGCTCAAGTGAAGGCTCCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122205 TTGAAGCCCTGAATGGCAAGGAGGTGGCGGCTCAAGTGAAGGCTCCACTT

    600     .    :
    556 GTTCTTAAAGAC
        ||||||||||||
 122255 GTTCTTAAAGAC