seq1 = pF1KB6828.tfa, 564 bp
seq2 = pF1KB6828/gi568815593r_52998605.tfa (gi568815593r:52998605_53207174), 208570 bp

>pF1KB6828 564
>gi568815593r:52998605_53207174 (Chr5)

(complement)

1-98  (100001-100098)   100% ->
99-226  (104951-105078)   100% ->
227-377  (105666-105816)   100% ->
378-501  (106641-106764)   100% ->
502-564  (108508-108570)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGAGCTTGGAGATCAGCTCCTCGTGCTTCAGCCTGGAGACGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGAGCTTGGAGATCAGCTCCTCGTGCTTCAGCCTGGAGACGAAATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGTTATCCCCCCCATTAGTGGAGGATAGTGCTTTTGAGCCATCTAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100051 GCCGTTATCCCCCCCATTAGTGGAGGATAGTGCTTTTGAGCCATCTAGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     99        GAAAGATATGGATGAAGTTGAAGAGAAATCTAAAGATGTTATA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 A...TAGGAAAGATATGGATGAAGTTGAAGAGAAATCTAAAGATGTTATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACTTTACTGCCGAGAAACTTTCAGTAGATGAAGTCTCACAGTTGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104994 AACTTTACTGCCGAGAAACTTTCAGTAGATGAAGTCTCACAGTTGGTGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCTCCGCTCTGTGGTGCAATATCCCTATTTGTAG         GGACTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 105044 TTCTCCGCTCTGTGGTGCAATATCCCTATTTGTAGGTG...AAGGGACTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAAGAAATAACTTTGAAGGGAAAAAAGTCATTAGCTTAGAATATGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105672 CAAGAAATAACTTTGAAGGGAAAAAAGTCATTAGCTTAGAATATGAAGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATCTACCCATGGCGGAAAATGAAGTCAGAAAGATTTGTAGTGACATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105722 TATCTACCCATGGCGGAAAATGAAGTCAGAAAGATTTGTAGTGACATTAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGAAATGGCCAGTCAAACACATAGCAGTGTTCCATAGACTTGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 105772 GCAGAAATGGCCAGTCAAACACATAGCAGTGTTCCATAGACTTGGGTA..

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    378     CTTGGTTCCAGTGTCAGAAGCAAGCATAATCATTGCTGTGTCCTCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105822 .AAGCTTGGTTCCAGTGTCAGAAGCAAGCATAATCATTGCTGTGTCCTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCCACAGAGCTGCATCTCTTGAAGCTGTGAGCTATGCCATTGATACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106687 GCCCACAGAGCTGCATCTCTTGAAGCTGTGAGCTATGCCATTGATACTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAAAGCCAAGGTGCCCATATGGAAAAAG         GAAATATACGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 106737 AAAAGCCAAGGTGCCCATATGGAAAAAGGTA...TAGGAAATATACGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGTCATCAACTTGGAAAGGAAACAAAGAGTGCTTTTGGGCATCCAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108521 AGTCATCAACTTGGAAAGGAAACAAAGAGTGCTTTTGGGCATCCAACAGT