seq1 = pF1KB6816.tfa, 555 bp
seq2 = pF1KB6816/gi568815594f_69832556.tfa (gi568815594f:69832556_70045002), 212447 bp

>pF1KB6816 555
>gi568815594f:69832556_70045002 (Chr4)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-84  (101657-101689)   100% ->
85-105  (102135-102155)   100% ->
106-129  (103371-103394)   100% ->
130-153  (103901-103924)   100% ->
154-195  (104011-104052)   100% ->
196-219  (104566-104589)   100% ->
220-243  (105245-105268)   100% ->
244-276  (106621-106653)   100% ->
277-300  (107466-107489)   100% ->
301-342  (108464-108505)   100% ->
343-360  (109491-109508)   100% ->
361-402  (109981-110022)   100% ->
403-555  (112295-112447)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGCTTCTCATTCTCACCTGTCTTGTGGCTGTTGCTCTTGCCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGCTTCTCATTCTCACCTGTCTTGTGGCTGTTGCTCTTGCCAGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 T         AAACTTCCTCTTAGATACCCAGAACGCCTTCAG       
        |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100051 TGTA...CAGAAACTTCCTCTTAGATACCCAGAACGCCTTCAGGTA...C

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     85   AATCCATCAGAGAGCAGTGAG         CCTATACCATTAGAATCA
        >>|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102133 AGAATCCATCAGAGAGCAGTGAGGTA...TAGCCTATACCATTAGAATCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    124 AGAGAG         GAATACATGAATGGTATGAACAGG         CA
        ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 103389 AGAGAGGTA...AAGGAATACATGAATGGTATGAACAGGGTA...TAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    156 GAGAAACATTCTGAGAGAAAAACAGACTGATGAAATCAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 104013 GAGAAACATTCTGAGAGAAAAACAGACTGATGAAATCAAGGTA...CAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    197 ATACTAGGAATGAGTCTACTCAG         AACTGTGTTGTGGCAGAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104567 ATACTAGGAATGAGTCTACTCAGGTG...AAGAACTGTGTTGTGGCAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    238 CCTGAG         AAGATGGAATCCAGCATCAGTTCATCGAGTGAG  
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 105263 CCTGAGGTA...TAGAAGATGGAATCCAGCATCAGTTCATCGAGTGAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    277        GAAATGTCTCTCAGTAAGTGTGCG         GAACAGTTTT
        >...>>>||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 106656 A...AAGGAAATGTCTCTCAGTAAGTGTGCGGTA...TAGGAACAGTTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    311 GTAGACTGAACGAATACAACCAACTTCAGCTG         CAAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 108474 GTAGACTGAACGAATACAACCAACTTCAGCTGGTA...TAGCAAGCTGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    352 CATGCCCAG         GAGCAAATTCGCAGAATGAATGAAAACAGCCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 109500 CATGCCCAGGTG...CAGGAGCAAATTCGCAGAATGAATGAAAACAGCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    393 TGTCCAAGTG         CCTTTCCAGCAGCTCAACCAACTTGCTGCCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 110013 TGTCCAAGTGGTA...TAGCCTTTCCAGCAGCTCAACCAACTTGCTGCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    434 ACCCCTATGCTGTTTGGTACTATCCACAAATCATGCAGTATGTTCCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112326 ACCCCTATGCTGTTTGGTACTATCCACAAATCATGCAGTATGTTCCTTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    484 CCACCGTTTTCCGACATCTCCAATCCCACTGCTCATGAAAATTATGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112376 CCACCGTTTTCCGACATCTCCAATCCCACTGCTCATGAAAATTATGAAAA

    650     .    :    .    :
    534 AAATAACGTCATGCTACAGTGG
        ||||||||||||||||||||||
 112426 AAATAACGTCATGCTACAGTGG