seq1 = pF1KB6814.tfa, 555 bp
seq2 = pF1KB6814/gi568815594r_144895376.tfa (gi568815594r:144895376_145196099), 300724 bp

>pF1KB6814 555
>gi568815594r:144895376_145196099 (Chr4)

(complement)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-206  (114350-114440)   100% ->
207-327  (131408-131528)   100% ->
328-555  (200497-200724)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTACACCAAACAAGACACCTCCTGGTGCTGACCCCAAGCAGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTACACCAAACAAGACACCTCCTGGTGCTGACCCCAAGCAGTTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAGGACTGGAACAGTACGGGAAATTGGGTCACAAGCTGTTTGGTCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAGGACTGGAACAGTACGGGAAATTGGGTCACAAGCTGTTTGGTCACTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATCTTGCAAACCAG         GATTTGGAGTGGATCAGTTACGAGAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 CATCTTGCAAACCAGGTA...TAGGATTTGGAGTGGATCAGTTACGAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACAATCTAGAAACTTATTGGCAATCAGATGGTTCCCAGCCTCATTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114376 GACAATCTAGAAACTTATTGGCAATCAGATGGTTCCCAGCCTCATTTAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAACATCCAATTCAG         AAGAAAAACAACAGTGAAGACATTAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 114426 GAACATCCAATTCAGGTA...TAGAAGAAAAACAACAGTGAAGACATTAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTATTTATGCAGACTACAAATCTGATGAAAGCTATACTCCAAGCAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131434 GTATTTATGCAGACTACAAATCTGATGAAAGCTATACTCCAAGCAAGATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCAGTCAGAGTAGGAAATAATTTTCACAACCTTCAAGAAATTCGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 131484 TCAGTCAGAGTAGGAAATAATTTTCACAACCTTCAAGAAATTCGGGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    328     CAACTTGAGTTGGTGGAACCAAGTGGCTGGATTCATGTTCCCTTAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131534 .CAGCAACTTGAGTTGGTGGAACCAAGTGGCTGGATTCATGTTCCCTTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTGACAATCATAAGAAGCCAACTCGTACATTCATGATACAGATTGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200543 CTGACAATCATAAGAAGCCAACTCGTACATTCATGATACAGATTGCTGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTAGCCAATCACCAGAATGGAAGAGACACCCATATGAGACAAATTAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200593 CTAGCCAATCACCAGAATGGAAGAGACACCCATATGAGACAAATTAAAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATACACACCAGTAGAAGAGAGCTCCATTGGTAAATTTCCTAGATGTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200643 ATACACACCAGTAGAAGAGAGCTCCATTGGTAAATTTCCTAGATGTACAA

    550     .    :    .    :    .    :
    524 CTATAGATTTCATGATGTATCGTTCAATAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 200693 CTATAGATTTCATGATGTATCGTTCAATAAGG