seq1 = pF1KB6811.tfa, 480 bp
seq2 = pF1KB6811/gi568815579f_2376359.tfa (gi568815579f:2376359_2577598), 201240 bp

>pF1KB6811 480
>gi568815579f:2376359_2577598 (Chr19)

1-44  (100001-100044)   100% ->
45-146  (100171-100272)   100% ->
147-369  (100671-100893)   100% ->
370-480  (101130-101240)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGCTGGAAGAGCTCGTGGCGTGCGACAACGCGGCGCAGAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100001 ATGACGCTGGAAGAGCTCGTGGCGTGCGACAACGCGGCGCAGAAGTA...

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     45    GATGCAGACGGTGACCGCCGCGGTGGAGGAGCTTTTGGTGGCCGCTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100168 CAGGATGCAGACGGTGACCGCCGCGGTGGAGGAGCTTTTGGTGGCCGCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCGCCAGGATCGCCTCACAGTGGGGGTGTACGAGTCGGCCAAGTTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100218 AGCGCCAGGATCGCCTCACAGTGGGGGTGTACGAGTCGGCCAAGTTGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATGT         GGACCCAGACAGCGTGGTCCTCTGCCTCTTGGCCAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100268 AATGTGTG...CAGGGACCCAGACAGCGTGGTCCTCTGCCTCTTGGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGACGAGGAGGAGGAGGATGACATCGCCCTGCAAATCCACTTCACGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100707 TGACGAGGAGGAGGAGGATGACATCGCCCTGCAAATCCACTTCACGCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCAGTCCTTCTGCTGTGACAACGACATCAACATCGTGCGGGTGTCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100757 TCCAGTCCTTCTGCTGTGACAACGACATCAACATCGTGCGGGTGTCGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATGCAGCGCCTGGCGCAGCTCCTGGGAGAGCCGGCCGAGACCCAGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100807 ATGCAGCGCCTGGCGCAGCTCCTGGGAGAGCCGGCCGAGACCCAGGGCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACCGAGGCCCGAGACCTGCATTGTCTCCTGGTCACG         AACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100857 CACCGAGGCCCGAGACCTGCATTGTCTCCTGGTCACGGTG...CAGAACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTCACACGGACGCCTGGAAGAGCCACGGCTTGGTGGAGGTGGCCAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101134 CTCACACGGACGCCTGGAAGAGCCACGGCTTGGTGGAGGTGGCCAGCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGCGAAGAAAGCCGGGGCAACAACCAGTGGGTCCCCTACATCTCTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101184 TGCGAAGAAAGCCGGGGCAACAACCAGTGGGTCCCCTACATCTCTCTTCA

    500     .
    474 GGAACGC
        |||||||
 101234 GGAACGC