seq1 = pF1KB6810.tfa, 555 bp
seq2 = pF1KB6810/gi568815581r_47971438.tfa (gi568815581r:47971438_48177004), 205567 bp

>pF1KB6810 555
>gi568815581r:47971438_48177004 (Chr17)

(complement)

1-140  (100001-100140)   100% ->
141-318  (100827-101004)   100% ->
319-413  (101905-101999)   100% ->
414-555  (105426-105567)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAAAAAACAAAACAAGAAGAAAGTGGAGGAGGTGCTAGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGAAAAAACAAAACAAGAAGAAAGTGGAGGAGGTGCTAGAAGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAAGAGGAATATGTGGTGGAAAAAGTTCTCGACCGTCGAGTGGTAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAAGAGGAATATGTGGTGGAAAAAGTTCTCGACCGTCGAGTGGTAAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAAAGTGGAGTACCTCCTAAAGTGGAAGGGATTCTCAGA         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100101 GCAAAGTGGAGTACCTCCTAAAGTGGAAGGGATTCTCAGAGTA...CAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGACAACACATGGGAGCCAGAAGAGAACCTGGATTGCCCCGACCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100828 GAGGACAACACATGGGAGCCAGAAGAGAACCTGGATTGCCCCGACCTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCTGAGTTTCTGCAGTCACAGAAAACAGCACATGAGACAGATAAATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100878 TGCTGAGTTTCTGCAGTCACAGAAAACAGCACATGAGACAGATAAATCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGGAGGCAAGCGCAAAGCTGATTCTGATTCTGAAGATAAGGGAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100928 AGGGAGGCAAGCGCAAAGCTGATTCTGATTCTGAAGATAAGGGAGAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGCAAACCAAAGAAGAAGAAAGAAGAG         TCAGAAAAGCCACG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100978 AGCAAACCAAAGAAGAAGAAAGAAGAGGTA...CAGTCAGAAAAGCCACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGGCTTTGCTCGAGGTTTGGAGCCGGAGCGGATTATTGGAGCTACAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101919 AGGCTTTGCTCGAGGTTTGGAGCCGGAGCGGATTATTGGAGCTACAGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCAGTGGAGAGCTCATGTTCCTGATGAAATG         GAAAAACTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101969 CCAGTGGAGAGCTCATGTTCCTGATGAAATGGTG...CAGGAAAAACTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GATGAGGCTGACCTGGTCCCTGCCAAGGAAGCCAATGTCAAGTGCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105436 GATGAGGCTGACCTGGTCCCTGCCAAGGAAGCCAATGTCAAGTGCCCACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGTTGTCATATCCTTCTATGAGGAAAGGCTGACGTGGCATTCCTACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105486 GGTTGTCATATCCTTCTATGAGGAAAGGCTGACGTGGCATTCCTACCCCT

    550     .    :    .    :    .    :
    524 CGGAGGATGATGACAAAAAAGATGACAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 105536 CGGAGGATGATGACAAAAAAGATGACAAGAAC