seq1 = pF1KB6809.tfa, 477 bp
seq2 = pF1KB6809/gi568815597f_11645801.tfa (gi568815597f:11645801_11850189), 204389 bp

>pF1KB6809 477
>gi568815597f:11645801_11850189 (Chr1)

1-27  (90409-90435)   100% ->
28-62  (100003-100037)   100% ->
63-168  (101640-101745)   100% ->
169-364  (102615-102810)   100% ->
365-477  (104277-104389)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTGCCTGCTGTGAACCTGAAG         GTGATTCTCCTAGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
  90409 ATGGAGCTGCCTGCTGTGAACCTGAAGGTG...CAGGTGATTCTCCTAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCACTGGCTGCTGACAACCTG         GGGCTGCATTGTATTCTCAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100017 TCACTGGCTGCTGACAACCTGGTA...CAGGGGCTGCATTGTATTCTCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 GCTCCTATGCCTGGGCCAACTTCACCATCCTGGCCTTGGGCGTGTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101660 GCTCCTATGCCTGGGCCAACTTCACCATCCTGGCCTTGGGCGTGTGGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTGGCTCAGCGGGACTCCATCGACGCCATAAGCATG         TTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101710 GTGGCTCAGCGGGACTCCATCGACGCCATAAGCATGGTG...CAGTTTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 GGGTGGCTTGCTGGCCACCATCTTCCTGGACATCGTGCACATCAGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102620 GGGTGGCTTGCTGGCCACCATCTTCCTGGACATCGTGCACATCAGCATCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TCTACCCGCGGGTCAGCCTCACGGACACGGGCCGCTTTGGCGTGGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102670 TCTACCCGCGGGTCAGCCTCACGGACACGGGCCGCTTTGGCGTGGGCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCCATCCTCAGCTTGCTGCTCAAGCCGCTCTCCTGCTGCTTCGTCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102720 GCCATCCTCAGCTTGCTGCTCAAGCCGCTCTCCTGCTGCTTCGTCTACCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATGTACCGGGAGCGCGGGGGTGAGCTCCTGGTCCACACTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 102770 CATGTACCGGGAGCGCGGGGGTGAGCTCCTGGTCCACACTGGTG...TAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GTTTCCTTGGGTCTTCTCAGGACCGTAGTGCCTACCAGACGATTGACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104277 GTTTCCTTGGGTCTTCTCAGGACCGTAGTGCCTACCAGACGATTGACTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCAGAGGCGCCCGCAGATCCCTTTGCAGTCCCAGAGGGCAGGAGTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104327 GCAGAGGCGCCCGCAGATCCCTTTGCAGTCCCAGAGGGCAGGAGTCAAGA

    500     .    :
    465 TGCCCGAGGGTAC
        |||||||||||||
 104377 TGCCCGAGGGTAC