seq1 = pF1KB6805.tfa, 477 bp
seq2 = pF1KB6805/gi568815594r_70556332.tfa (gi568815594r:70556332_70766490), 210159 bp

>pF1KB6805 477
>gi568815594r:70556332_70766490 (Chr4)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-188  (104276-104399)   100% ->
189-269  (109200-109280)   100% ->
270-477  (109952-110159)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGAACCATTTGCTTTTCTGGGGAGTCCTGGCGGTTTTTATTAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGAACCATTTGCTTTTCTGGGGAGTCCTGGCGGTTTTTATTAAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTTCATGTGAAAG         CCCAAGAAGATGAAAGGATTGTTCTTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTTCATGTGAAAGGTA...AAGCCCAAGAAGATGAAAGGATTGTTCTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGACAACAAATGTAAGTGTGCCCGGATTACTTCCAGGATCATCCGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104303 TTGACAACAAATGTAAGTGTGCCCGGATTACTTCCAGGATCATCCGTTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCGAAGATCCTAATGAGGACATTGTGGAGAGAAACATCCGAATTAT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 104353 TCCGAAGATCCTAATGAGGACATTGTGGAGAGAAACATCCGAATTATGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    189       TGTTCCTCTGAACAACAGGGAGAATATCTCTGATCCCACCTCAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104403 ...TAGTGTTCCTCTGAACAACAGGGAGAATATCTCTGATCCCACCTCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CATTGAGAACCAGATTTGTGTACCATTTGTCTGACCT         CTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 109244 CATTGAGAACCAGATTTGTGTACCATTTGTCTGACCTGTA...CAGCTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAAAAATGTGATCCTACAGAAGTGGAGCTGGATAATCAGATAGTTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109956 AAAAAATGTGATCCTACAGAAGTGGAGCTGGATAATCAGATAGTTACTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TACCCAGAGCAATATCTGTGATGAAGACAGTGCTACAGAGACCTGCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110006 TACCCAGAGCAATATCTGTGATGAAGACAGTGCTACAGAGACCTGCTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTTATGACAGAAACAAGTGCTACACAGCTGTGGTCCCACTCGTATATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110056 CTTATGACAGAAACAAGTGCTACACAGCTGTGGTCCCACTCGTATATGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGTGAGACCAAAATGGTGGAAACAGCCTTAACCCCAGATGCCTGCTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110106 GGTGAGACCAAAATGGTGGAAACAGCCTTAACCCCAGATGCCTGCTATCC

    500 
    474 TGAC
        ||||
 110156 TGAC