seq1 = pF1KB6804.tfa, 552 bp
seq2 = pF1KB6804/gi568815597f_111591361.tfa (gi568815597f:111591361_111809232), 217872 bp

>pF1KB6804 552
>gi568815597f:111591361_111809232 (Chr1)

1-57  (100001-100057)   100% ->
58-126  (103981-104049)   100% ->
127-183  (106081-106137)   100% ->
184-324  (111976-112116)   100% ->
325-468  (112983-113126)   100% ->
469-552  (117789-117872)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGTGAGTACAAGCTAGTGGTCCTTGGTTCAGGAGGCGTTGGGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGTGAGTACAAGCTAGTGGTCCTTGGTTCAGGAGGCGTTGGGAAGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCTCTG         ACAGTTCAGTTTGTTCAGGGAATTTTTGTTGAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCTCTGGTA...CAGACAGTTCAGTTTGTTCAGGGAATTTTTGTTGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AATATGACCCAACGATAGAAGATTCCTACAGAAAG         CAAGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 104015 AATATGACCCAACGATAGAAGATTCCTACAGAAAGGTA...CAGCAAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GAAGTCGATTGCCAACAGTGTATGCTCGAAATCCTGGATACTGCAGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106087 GAAGTCGATTGCCAACAGTGTATGCTCGAAATCCTGGATACTGCAGGGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 A         GAGCAATTTACAGCAATGAGGGATTTGTATATGAAGAACG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106137 AGTA...TAGGAGCAATTTACAGCAATGAGGGATTTGTATATGAAGAACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GCCAAGGTTTTGCACTAGTATATTCTATTACAGCTCAGTCCACGTTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112016 GCCAAGGTTTTGCACTAGTATATTCTATTACAGCTCAGTCCACGTTTAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GACTTACAGGACCTGAGGGAACAGATTTTACGGGTTAAGGACACGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112066 GACTTACAGGACCTGAGGGAACAGATTTTACGGGTTAAGGACACGGAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 T         GTTCCAATGATTTTGGTTGGCAATAAATGTGACCTGGAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112116 TGTA...CAGGTTCCAATGATTTTGGTTGGCAATAAATGTGACCTGGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATGAGCGAGTAGTTGGCAAAGAGCAGGGCCAGAATTTAGCAAGACAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113023 ATGAGCGAGTAGTTGGCAAAGAGCAGGGCCAGAATTTAGCAAGACAGTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TGTAACTGTGCCTTTTTAGAATCTTCTGCAAAGTCAAAGATCAATGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113073 TGTAACTGTGCCTTTTTAGAATCTTCTGCAAAGTCAAAGATCAATGTTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGAG         ATATTTTATGACCTGGTCAGACAGATAAATAGGAAAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113123 TGAGGTA...TAGATATTTTATGACCTGGTCAGACAGATAAATAGGAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    506 CACCAGTGGAAAAGAAGAAGCCTAAAAAGAAATCATGTCTGCTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117826 CACCAGTGGAAAAGAAGAAGCCTAAAAAGAAATCATGTCTGCTGCTC