seq1 = pF1KB6792.tfa, 465 bp
seq2 = pF1KB6792/gi568815596f_112960851.tfa (gi568815596f:112960851_113162674), 201824 bp

>pF1KB6792 465
>gi568815596f:112960851_113162674 (Chr2)

1-29  (98589-98617)   100% ->
30-115  (100002-100087)   100% ->
116-243  (101274-101401)   100% ->
244-465  (101603-101824)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCCTGAGTGGGGCGCTGTGCTTCCG         AATGAAGGACTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
  98589 ATGGTCCTGAGTGGGGCGCTGTGCTTCCGGTG...CAGAATGAAGGACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGCATTGAAGGTGCTTTATCTGCATAATAACCAGCTTCTAGCTGGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100014 GGCATTGAAGGTGCTTTATCTGCATAATAACCAGCTTCTAGCTGGAGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCATGCAGGGAAGGTCATTAAAG         GTGAAGAGATCAGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100064 TGCATGCAGGGAAGGTCATTAAAGGTT...CAGGTGAAGAGATCAGCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTCCCCAATCGGTGGCTGGATGCCAGCCTGTCCCCCGTCATCCTGGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101291 GTCCCCAATCGGTGGCTGGATGCCAGCCTGTCCCCCGTCATCCTGGGTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCAGGGTGGAAGCCAGTGCCTGTCATGTGGGGTGGGGCAGGAGCCGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101341 CCAGGGTGGAAGCCAGTGCCTGTCATGTGGGGTGGGGCAGGAGCCGACTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TAACACTAGAG         CCAGTGAACATCATGGAGCTCTATCTTGGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101391 TAACACTAGAGGTG...CAGCCAGTGAACATCATGGAGCTCTATCTTGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCCAAGGAATCCAAGAGCTTCACCTTCTACCGGCGGGACATGGGGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101633 GCCAAGGAATCCAAGAGCTTCACCTTCTACCGGCGGGACATGGGGCTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTCCAGCTTCGAGTCGGCTGCCTACCCGGGCTGGTTCCTGTGCACGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101683 CTCCAGCTTCGAGTCGGCTGCCTACCCGGGCTGGTTCCTGTGCACGGTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTGAAGCCGATCAGCCTGTCAGACTCACCCAGCTTCCCGAGAATGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101733 CTGAAGCCGATCAGCCTGTCAGACTCACCCAGCTTCCCGAGAATGGTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGGAATGCCCCCATCACAGACTTCTACTTCCAGCAGTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101783 TGGAATGCCCCCATCACAGACTTCTACTTCCAGCAGTGTGAC