seq1 = pF1KB6790.tfa, 465 bp
seq2 = pF1KB6790/gi568815593r_142495293.tfa (gi568815593r:142495293_142714127), 218835 bp

>pF1KB6790 465
>gi568815593r:142495293_142714127 (Chr5)

(complement)

1-169  (100001-100169)   100% ->
170-273  (113323-113426)   100% ->
274-465  (118644-118835)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAAGGGGAAATCACCACCTTCACAGCCCTGACCGAGAAGTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGAAGGGGAAATCACCACCTTCACAGCCCTGACCGAGAAGTTTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGCCTCCAGGGAATTACAAGAAGCCCAAACTCCTCTACTGTAGCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTGCCTCCAGGGAATTACAAGAAGCCCAAACTCCTCTACTGTAGCAACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGGCCACTTCCTGAGGATCCTTCCGGATGGCACAGTGGATGGGACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGGCCACTTCCTGAGGATCCTTCCGGATGGCACAGTGGATGGGACAAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACAGGAGCGACCAGCACA         TTCAGCTGCAGCTCAGTGCGGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100151 GACAGGAGCGACCAGCACAGTA...CAGTTCAGCTGCAGCTCAGTGCGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAGCGTGGGGGAGGTGTATATAAAGAGTACCGAGACTGGCCAGTACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113345 AAGCGTGGGGGAGGTGTATATAAAGAGTACCGAGACTGGCCAGTACTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCATGGACACCGACGGGCTTTTATACGGCTCA         CAGACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 113395 CCATGGACACCGACGGGCTTTTATACGGCTCAGTA...TAGCAGACACCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATGAGGAATGTTTGTTCCTGGAAAGGCTGGAGGAGAACCATTACAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118653 AATGAGGAATGTTTGTTCCTGGAAAGGCTGGAGGAGAACCATTACAACAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTATATATCCAAGAAGCATGCAGAGAAGAATTGGTTTGTTGGCCTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118703 CTATATATCCAAGAAGCATGCAGAGAAGAATTGGTTTGTTGGCCTCAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGAATGGGAGCTGCAAACGCGGTCCTCGGACTCACTATGGCCAGAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118753 AGAATGGGAGCTGCAAACGCGGTCCTCGGACTCACTATGGCCAGAAAGCA

    450     .    :    .    :    .    :
    433 ATCTTGTTTCTCCCCCTGCCAGTCTCTTCTGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 118803 ATCTTGTTTCTCCCCCTGCCAGTCTCTTCTGAT