seq1 = pF1KB6787.tfa, 375 bp
seq2 = pF1KB6787/gi568815593r_115951913.tfa (gi568815593r:115951913_116152265), 200353 bp

>pF1KB6787 375
>gi568815593r:115951913_116152265 (Chr5)

(complement)

1-375  (99982-100353)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCCTAAGGACGACAAGAAGAAGAAGGACGCTGGAAAGTCGGCCAA
        |||||||| |||||||||--||-||||||||||||||||||||| |||||
  99982 ATGCCGCCCAAGGACGAC  GA GAAGAAGGACGCTGGAAAGTCAGCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAAGACAAAGACCCAGTGAACAAATCCGGGGGCAAGGCCAAAAAGAAGA
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100029 GAAAAACAAAGACCCAGTGAACAAATCCGGGGGCAAGGCCAAAAAGAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTGGTCCAAAGGCAAAGTTCGGGACAAGCTCAATAACTTAGTCTTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100079 AGTGGTCCAAAGGCAAAGTTCGGGACAAGCTCAATAACTTAGTCTTGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACAAAGCTACCTATGATAAACTCTGTAAGGAAGTTCCCAACTATAAACT
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100129 GACAAAGCTACCTATGACAAACTCTGTAAGGAAGTTCCCAACTATAAACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TATAACCCCAGCTGTGGTCTCTGAGAGACTGAAGATTCGAGGCTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100179 TATAACCCCAGCTGTGGTCTCTGAGAGACTGAAGATTCGAGGCTCCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAGGGCAGCCCTTCAGGAGCTCCTTAGTAAAGGACTTATCAAACTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100229 CCAGGGCAGCCCTTCAGGAGCTCCTTAGTAAAGGACTTATCAAACTGGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCAAAGCACAGAGCTCAAGTAATTTACACCAGAAATACCAAGGGTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100279 TCAAAGCACAGAGCTCAAGTAATTTACACCAGAAATACCAAGGGTGGAGA

    350     .    :    .    :    .
    351 TGCTCCAGCTGCTGGTGAAGATGCA
        |||||||||||||||||||||||||
 100329 TGCTCCAGCTGCTGGTGAAGATGCA