seq1 = pF1KB6785.tfa, 375 bp
seq2 = pF1KB6785/gi568815578f_2971656.tfa (gi568815578f:2971656_3172415), 200760 bp

>pF1KB6785 375
>gi568815578f:2971656_3172415 (Chr20)

1-120  (100001-100120)   100% ->
121-322  (100422-100623)   100% ->
323-375  (100708-100760)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGGCCCCAGCCTCGCTTGCTGTCTGCTCGGCCTCCTGGCGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGGCCCCAGCCTCGCTTGCTGTCTGCTCGGCCTCCTGGCGCTGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCGCCTGCTACATCCAGAACTGCCCCCTGGGAGGCAAGAGGGCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCGCCTGCTACATCCAGAACTGCCCCCTGGGAGGCAAGAGGGCCGCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGACCTCGACGTGCGCAAG         TGCCTCCCCTGCGGCCCCGGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100101 CGGACCTCGACGTGCGCAAGGTG...CAGTGCCTCCCCTGCGGCCCCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCAAAGGCCGCTGCTTCGGGCCCAATATCTGCTGCGCGGAAGAGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100443 GGCAAAGGCCGCTGCTTCGGGCCCAATATCTGCTGCGCGGAAGAGCTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGCTTCGTGGGCACCGCCGAAGCGCTGCGCTGCCAGGAGGAGAACTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100493 CTGCTTCGTGGGCACCGCCGAAGCGCTGCGCTGCCAGGAGGAGAACTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCCGTCGCCCTGCCAGTCCGGCCAGAAGGCGTGCGGGAGCGGGGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100543 TGCCGTCGCCCTGCCAGTCCGGCCAGAAGGCGTGCGGGAGCGGGGGCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGCGCGGTCTTGGGCCTCTGCTGCAGCCCGG         ACGGCTGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100593 TGCGCGGTCTTGGGCCTCTGCTGCAGCCCGGGTG...CAGACGGCTGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGCCGACCCTGCCTGCGACGCGGAAGCCACCTTCTCCCAGCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100718 CGCCGACCCTGCCTGCGACGCGGAAGCCACCTTCTCCCAGCGC