seq1 = pF1KB6782.tfa, 459 bp
seq2 = pF1KB6782/gi568815594r_122351755.tfa (gi568815594r:122351755_122556440), 204686 bp

>pF1KB6782 459
>gi568815594r:122351755_122556440 (Chr4)

(complement)

1-147  (100001-100147)   99% ->
148-207  (100238-100297)   100% ->
208-351  (102588-102731)   100% ->
352-459  (104579-104686)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACAGGATGCAACTCCTGTCTTGCATTGCACTAAGTCTTGCACTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACAGGATGCAACTCCTGTCTTGCATTGCACTAAGTCTTGCACTTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACAAACAGTGCACCTACTTCAAGTTCTACAAAGAAAACACAGCTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACAAACAGTGCACCTACTTCAAGTTCTACAAAGAAAACACAGCTACAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAGCATTTACTTCTGGATTTACAGATGATTTTGAATGGAATTAAT   
        ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100101 TGGAGCATTTACTGCTGGATTTACAGATGATTTTGAATGGAATTAATGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    148       AATTACAAGAATCCCAAACTCACCAGGATGCTCACATTTAAGTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ...TAGAATTACAAGAATCCCAAACTCACCAGGATGCTCACATTTAAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTACATGCCCAAGAAG         GCCACAGAACTGAAACATCTTCAGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100282 TTACATGCCCAAGAAGGTA...TAGGCCACAGAACTGAAACATCTTCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTCTAGAAGAAGAACTCAAACCTCTGGAGGAAGTGCTAAATTTAGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102613 GTCTAGAAGAAGAACTCAAACCTCTGGAGGAAGTGCTAAATTTAGCTCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCAAAAACTTTCACTTAAGACCCAGGGACTTAATCAGCAATATCAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102663 AGCAAAAACTTTCACTTAAGACCCAGGGACTTAATCAGCAATATCAACGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AATAGTTCTGGAACTAAAG         GGATCTGAAACAACATTCATGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102713 AATAGTTCTGGAACTAAAGGTA...TAGGGATCTGAAACAACATTCATGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTGAATATGCTGATGAGACAGCAACCATTGTAGAATTTCTGAACAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104601 GTGAATATGCTGATGAGACAGCAACCATTGTAGAATTTCTGAACAGATGG

    450     .    :    .    :    .    :    .
    424 ATTACCTTTTGTCAAAGCATCATCTCAACACTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104651 ATTACCTTTTGTCAAAGCATCATCTCAACACTGACT