seq1 = pF1KB6780.tfa, 426 bp
seq2 = pF1KB6780/gi568815584r_54378091.tfa (gi568815584r:54378091_54583768), 205678 bp

>pF1KB6780 426
>gi568815584r:54378091_54583768 (Chr14)

(complement)

1-100  (99998-100098)   99% ->
101-150  (101567-101616)   100% ->
151-200  (102311-102360)   100% ->
201-283  (102813-102895)   100% ->
284-357  (103910-103983)   100% ->
358-426  (105610-105678)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 AT GAGTGAGTCTTTGGTTGTTTGTGATGTTGCCGAAGATTTAGTGGAAA
        ||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 ATAGAGTGAGTCTTTGGTTGTTTGTGATGTTGCCGAAGATTTAGTGGAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 AGCTGAGAAAGTTTCGTTTTCGCAAAGAAACGAACAACGCTGCTATTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100048 AGCTGAGAAAGTTTCGTTTTCGCAAAGAAACGAACAACGCTGCTATTATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100 A         TGAAGATTGACAAGGATAAACGCCTGGTGGTACTGGATGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100098 AGTA...TAGTGAAGATTGACAAGGATAAACGCCTGGTGGTACTGGATGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141 GGAGCTTGAG         GGCATTTCACCAGATGAACTTAAAGATGAAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101607 GGAGCTTGAGGTT...CAGGGCATTTCACCAGATGAACTTAAAGATGAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    182 TACCTGAACGACAACCTCG         CTTCATTGTGTATAGTTATAAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102342 TACCTGAACGACAACCTCGATA...AACCTTCATTGTGTATAGTTATAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    223 TATCAACATGATGATGGAAGAGTTTCATATCCTCTGTGCTTTATTTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102835 TATCAACATGATGATGGAAGAGTTTCATATCCTCTGTGCTTTATTTTCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    273 CAGTCCTGTTG         GATGTAAGCCTGAACAACAGATGATGTATG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 102885 CAGTCCTGTTGGTA...CAGGATGTAAGCCTGAACAACAGATGATGTATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    314 CTGGAAGTAAGAATAAGCTAGTCCAGACAGCTGAACTAACCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103940 CTGGAAGTAAGAATAAGCTAGTCCAGACAGCTGAACTAACCAAGGTG...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    358    GTATTTGAAATAAGAAATACCGAAGACCTAACTGAAGAATGGTTACG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105607 AAGGTATTTGAAATAAGAAATACCGAAGACCTAACTGAAGAATGGTTACG

    450     .    :    .    :
    405 TGAGAAACTTGGATTTTTTCAC
        ||||||||||||||||||||||
 105657 TGAGAAACTTGGATTTTTTCAC