seq1 = pF1KB6769.tfa, 348 bp
seq2 = pF1KB6769/gi568815595r_10186704.tfa (gi568815595r:10186704_10390180), 203477 bp

>pF1KB6769 348
>gi568815595r:10186704_10390180 (Chr3)

(complement)

1-108  (100001-100108)   100% ->
109-222  (100306-100419)   100% ->
223-331  (103369-103477)   100% ->
332-348  (104287-104303)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCTCCCCAGGGACCGTCTGCAGCCTCCTGCTCCTCGGCATGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCTCCCCAGGGACCGTCTGCAGCCTCCTGCTCCTCGGCATGCTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGACTTGGCCATGGCAGGCTCCAGCTTCCTGAGCCCTGAACACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGACTTGGCCATGGCAGGCTCCAGCTTCCTGAGCCCTGAACACCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGTCCAG         AGAAAGGAGTCGAAGAAGCCACCAGCCAAGCTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGTCCAGGTG...CAGAGAAAGGAGTCGAAGAAGCCACCAGCCAAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGCCCCGAGCTCTAGCAGGCTGGCTCCGCCCGGAAGATGGAGGTCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100339 CAGCCCCGAGCTCTAGCAGGCTGGCTCCGCCCGGAAGATGGAGGTCAAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAAGGGGCAGAGGATGAACTGGAAGTCCGG         TTCAACGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100389 AGAAGGGGCAGAGGATGAACTGGAAGTCCGGGTC...TAGTTCAACGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCTTTGATGTTGGAATCAAGCTGTCAGGGGTTCAGTACCAGCAGCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103379 CCTTTGATGTTGGAATCAAGCTGTCAGGGGTTCAGTACCAGCAGCACAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGGCCCTGGGGAAGTTTCTTCAGGACATCCTCTGGGAAGAGGCCAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 103429 CAGGCCCTGGGGAAGTTTCTTCAGGACATCCTCTGGGAAGAGGCCAAAGG

    350     .    :    .    :    .
    332         AGGCCCCAGCCGACAAG
        >>...>>>|||||||||||||||||
 103479 TG...CAGAGGCCCCAGCCGACAAG