seq1 = pF1KB6768.tfa, 444 bp
seq2 = pF1KB6768/gi568815586r_120222196.tfa (gi568815586r:120222196_120426023), 203828 bp

>pF1KB6768 444
>gi568815586r:120222196_120426023 (Chr12)

(complement)

1-34  (98271-98304)   100% ->
35-194  (100004-100163)   100% ->
195-322  (100963-101090)   99% ->
323-444  (103707-103828)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAACTCCTTGTGCTAGCTGTGCTGCTCACAG         TGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  98271 ATGAAACTCCTTGTGCTAGCTGTGCTGCTCACAGGTA...CAGTGGCCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CGCCGACAGCGGCATCAGCCCTCGGGCCGTGTGGCAGTTCCGCAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100011 CGCCGACAGCGGCATCAGCCCTCGGGCCGTGTGGCAGTTCCGCAAAATGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCAAGTGCGTGATCCCGGGGAGTGACCCCTTCTTGGAATACAACAACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100061 TCAAGTGCGTGATCCCGGGGAGTGACCCCTTCTTGGAATACAACAACTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCTGCTACTGTGGCTTGGGGGGCTCAGGCACCCCCGTGGATGAACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100111 GGCTGCTACTGTGGCTTGGGGGGCTCAGGCACCCCCGTGGATGAACTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAA         GTGCTGCCAGACACATGACAACTGCTATGACCAGGCCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100161 CAAGTA...CAGGTGCTGCCAGACACATGACAACTGCTATGACCAGGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAAGCTGGACAGCTGTAAATTTCTGCTGGACAACCCGTACACCCACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGAAGCTGGACAGCTGTAAATTTCTGCTGGACAACCCGTACACCCACACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATTCATACTCATGCTCTGGCTCGGCAATCACCTGTAGCA         G
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 101051 TATTCATACTCGTGCTCTGGCTCGGCAATCACCTGTAGCAGTA...CAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAAAAACAAAGAGTGTGAGGCCTTCATTTGCAACTGCGACCGCAACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103708 CAAAAACAAAGAGTGTGAGGCCTTCATTTGCAACTGCGACCGCAACGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCATCTGCTTTTCAAAAGCTCCATATAACAAGGCACACAAGAACCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103758 CCATCTGCTTTTCAAAAGCTCCATATAACAAGGCACACAAGAACCTGGAC

    450     .    :    .    :
    424 ACCAAGAAGTATTGTCAGAGT
        |||||||||||||||||||||
 103808 ACCAAGAAGTATTGTCAGAGT