seq1 = pF1KB6756.tfa, 438 bp
seq2 = pF1KB6756/gi568815593f_132558187.tfa (gi568815593f:132558187_132760279), 202093 bp

>pF1KB6756 438
>gi568815593f:132558187_132760279 (Chr5)

1-174  (100001-100174)   100% ->
175-228  (101232-101285)   100% ->
229-333  (101538-101642)   100% ->
334-438  (101989-102093)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCATCCGCTCCTCAATCCTCTCCTGTTGGCACTGGGCCTCATGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCATCCGCTCCTCAATCCTCTCCTGTTGGCACTGGGCCTCATGGCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTGTTGACCACGGTCATTGCTCTCACTTGCCTTGGCGGCTTTGCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTGTTGACCACGGTCATTGCTCTCACTTGCCTTGGCGGCTTTGCCTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGGCCCTGTGCCTCCCTCTACAGCCCTCAGGGAGCTCATTGAGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGGCCCTGTGCCTCCCTCTACAGCCCTCAGGGAGCTCATTGAGGAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCAACATCACCCAGAACCAGAAG         GCTCCGCTCTGCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100151 GTCAACATCACCCAGAACCAGAAGGTG...CAGGCTCCGCTCTGCAATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGCATGGTATGGAGCATCAACCTGACAGCTGGCATG         TACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101249 CAGCATGGTATGGAGCATCAACCTGACAGCTGGCATGGTA...CAGTACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGCAGCCCTGGAATCCCTGATCAACGTGTCAGGCTGCAGTGCCATCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101542 GTGCAGCCCTGGAATCCCTGATCAACGTGTCAGGCTGCAGTGCCATCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGACCCAGAGGATGCTGAGCGGATTCTGCCCGCACAAGGTCTCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101592 AAGACCCAGAGGATGCTGAGCGGATTCTGCCCGCACAAGGTCTCAGCTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 G         CAGTTTTCCAGCTTGCATGTCCGAGACACCAAAATCGAGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101642 GGTA...CAGCAGTTTTCCAGCTTGCATGTCCGAGACACCAAAATCGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGCCCAGTTTGTAAAGGACCTGCTCTTACATTTAAAGAAACTTTTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102029 TGGCCCAGTTTGTAAAGGACCTGCTCTTACATTTAAAGAAACTTTTTCGC

    450     .    :    .
    424 GAGGGACAGTTCAAC
        |||||||||||||||
 102079 GAGGGACAGTTCAAC