seq1 = pF1KB6752.tfa, 435 bp
seq2 = pF1KB6752/gi568815596r_171417273.tfa (gi568815596r:171417273_171617716), 200444 bp

>pF1KB6752 435
>gi568815596r:171417273_171617716 (Chr2)

(complement)

1-435  (100001-100444)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAAGTAGAGCAGAAGAAGAAGCGGACCTTCCGCAAGTTCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAAGTAGAGCAGAAGAAGAAGCGGACCTTCCGCAAGTTCACCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCGGCGTGGACCTCGACCAGCTGCTGGACATGTCCTACGAGCAGCT  
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||--
 100051 CCGCGGCGTGGACCTGGACCAGCTGCTGGACATGTCCTACGAGCAGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     99        GATGCAGCTGTACAGTGCGCGCCAGCGGCGGCGGCTGAACCGG
        -------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCAGCCGATGCAGCTGTACAGTGCGCGCCAGCGGCGGCGGCTGAACCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCCTGCGGCGGAAGCAGCACTCCCTGCTGAAGCGCCTGCGCAAGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCCTGCGGCGGAAGCAGCACTCCCTGCTGAAGCGCCTGCGCAAGGCCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGGAGGCGCCGCCCATGGAGAAGCCGGAAGTGGTGAAGACGCACCTGC
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGGAGGCGCCGCCCATGGAGAAGCAGGAAGTGGTGAAGACGCACCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGACATGATCATCCTACCCGAGATGGTGGGCAGCATGGTGGGCGTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGACATGATCATCCTACCCGAGATGGTGGGCAGCATGGTGGGCGTCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AACGGCAAGACCTTCAACCAGGTGGAGATCAAGCCCGAGATGATCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACGGCAAGACCTTCAACCAGGTGGAGATCAAGCCCGAGATGATCGGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTACCTGGGCGAGTTCTCCATCACCTACAAGCCCGTAAAGCATGGCCGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100351 CTACCTGGGCGAGTTCTCCATCACCTACAAGCCCGTAAAGCACGGCCGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCGGCATCGGGGCCACCCACTCCTCCCGCTTCATCCCTCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCGGCATCGGGGCCACCCACTCCTCCCGCTTCATCCCTCTCAAG