seq1 = pF1KB6752.tfa, 435 bp
seq2 = pF1KB6752/gi568815579f_1338806.tfa (gi568815579f:1338806_1540459), 201654 bp

>pF1KB6752 435
>gi568815579f:1338806_1540459 (Chr19)

1-89  (100000-100087)   98% ->
90-324  (101214-101448)   100% ->
325-435  (101544-101654)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAAGTAGAGCAGAAGAAGAAGCGGACCTTCCGCAAGTTCACCTA
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GGCAGAAGTAGAGCAGAAGAAGAAGCGGACCTTCCGCAAGTTCACCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCGGCGTGGACCTCGACCAGCTGCTGGACATGTCCTA         CG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100049 CCGCGGCGTGGACCTCGACCAGCTGCTGGACATGTCCTAGTA...CAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCAGCTGATGCAGCTGTACAGTGCGCGCCAGCGGCGGCGGCTGAACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101216 AGCAGCTGATGCAGCTGTACAGTGCGCGCCAGCGGCGGCGGCTGAACCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCCTGCGGCGGAAGCAGCACTCCCTGCTGAAGCGCCTGCGCAAGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101266 GGCCTGCGGCGGAAGCAGCACTCCCTGCTGAAGCGCCTGCGCAAGGCCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGGAGGCGCCGCCCATGGAGAAGCCGGAAGTGGTGAAGACGCACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101316 GAAGGAGGCGCCGCCCATGGAGAAGCCGGAAGTGGTGAAGACGCACCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGACATGATCATCCTACCCGAGATGGTGGGCAGCATGGTGGGCGTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101366 GGGACATGATCATCCTACCCGAGATGGTGGGCAGCATGGTGGGCGTCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AACGGCAAGACCTTCAACCAGGTGGAGATCAAG         CCCGAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101416 AACGGCAAGACCTTCAACCAGGTGGAGATCAAGGTG...CAGCCCGAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GATCGGCCACTACCTGGGCGAGTTCTCCATCACCTACAAGCCCGTAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101552 GATCGGCCACTACCTGGGCGAGTTCTCCATCACCTACAAGCCCGTAAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGGCCGGCCCGGCATCGGGGCCACCCACTCCTCCCGCTTCATCCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101602 ATGGCCGGCCCGGCATCGGGGCCACCCACTCCTCCCGCTTCATCCCTCTC

    450 
    433 AAG
        |||
 101652 AAG