seq1 = pF1KB6747.tfa, 306 bp
seq2 = pF1KB6747/gi568815595f_14081557.tfa (gi568815595f:14081557_14298113), 216557 bp

>pF1KB6747 306
>gi568815595f:14081557_14298113 (Chr3)

1-21  (97305-97325)   100% ->
22-132  (100004-100114)   100% ->
133-228  (102381-102476)   100% ->
229-306  (116480-116557)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACGACGTAGACCAG         CAACAAACTACCAACACTGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
  97305 ATGGCGGACGACGTAGACCAGGTA...CAGCAACAAACTACCAACACTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGAGGAGCCCCTGGATCTTATCAGGCTCAGCCTAGATGAGCGAATTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100024 AGAGGAGCCCCTGGATCTTATCAGGCTCAGCCTAGATGAGCGAATTTATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAAAATGAGAAATGACCGAGAGCTTCGAGGCAGATTACAT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100074 TGAAAATGAGAAATGACCGAGAGCTTCGAGGCAGATTACATGTA...TAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCTTATGATCAACATTTAAATATGATCTTGGGAGATGTGGAAGAAACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102381 GCTTATGATCAACATTTAAATATGATCTTGGGAGATGTGGAAGAAACTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GACTACTATAGAAATTGATGAAGAAACATATGAAGAGATATATAAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 102431 GACTACTATAGAAATTGATGAAGAAACATATGAAGAGATATATAAAGTA.

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    229      TCAACGAAACGGAATATTCCAATGCTCTTTGTCCGGGGAGATGGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102481 ..TAGTCAACGAAACGGAATATTCCAATGCTCTTTGTCCGGGGAGATGGC

    300     .    :    .    :    .    :
    274 GTTGTCCTGGTTGCCCCTCCACTGAGAGTTGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 116525 GTTGTCCTGGTTGCCCCTCCACTGAGAGTTGGC