seq1 = pF1KB6744.tfa, 432 bp
seq2 = pF1KB6744/gi568815593r_135792394.tfa (gi568815593r:135792394_135995816), 203423 bp

>pF1KB6744 432
>gi568815593r:135792394_135995816 (Chr5)

(complement)

1-114  (100001-100114)   100% ->
115-150  (100227-100262)   100% ->
151-183  (100345-100377)   100% ->
184-315  (101666-101797)   100% ->
316-432  (103307-103423)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTCTGGCCATGGTCCTTACCTCTGCCCTGCTCCTGTGCTCCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTTCTGGCCATGGTCCTTACCTCTGCCCTGCTCCTGTGCTCCGTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGCCAGGGGTGTCCAACCTTGGCGGGGATCCTGGACATCAACTTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGCCAGGGGTGTCCAACCTTGGCGGGGATCCTGGACATCAACTTCCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAACAAGATGCAG         GAAGATCCAGCTTCCAAGTGCCACTGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCAACAAGATGCAGGTA...TAGGAAGATCCAGCTTCCAAGTGCCACTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGTGCTAAT         GTGACCAGTTGTCTCTGTTTGGGCATTCCCTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100254 AGTGCTAATGTG...CAGGTGACCAGTTGTCTCTGTTTGGGCATTCCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 T         GACAACTGCACCAGACCATGCTTCAGTGAGAGACTGTCTC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100377 TGTA...CAGGACAACTGCACCAGACCATGCTTCAGTGAGAGACTGTCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGATGACCAATACCACCATGCAAACAAGATACCCACTGATTTTCAGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101706 AGATGACCAATACCACCATGCAAACAAGATACCCACTGATTTTCAGTCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTGAAAAAATCAGTTGAAGTACTAAAGAACAACAAGTGTCCA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101756 GTGAAAAAATCAGTTGAAGTACTAAAGAACAACAAGTGTCCAGTA...CA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    316  TATTTTTCCTGTGAACAGCCATGCAACCAAACCACGGCAGGCAACGCGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103306 GTATTTTTCCTGTGAACAGCCATGCAACCAAACCACGGCAGGCAACGCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGACATTTCTGAAGAGTCTTCTGGAAATTTTCCAGAAAGAAAAGATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103356 TGACATTTCTGAAGAGTCTTCTGGAAATTTTCCAGAAAGAAAAGATGAGA

    450     .    :    .
    415 GGGATGAGAGGCAAGATA
        ||||||||||||||||||
 103406 GGGATGAGAGGCAAGATA