seq1 = pF1KB6742.tfa, 426 bp
seq2 = pF1KB6742/gi568815587f_64142388.tfa (gi568815587f:64142388_64344026), 201639 bp

>pF1KB6742 426
>gi568815587f:64142388_64344026 (Chr11)

1-171  (100001-100171)   100% ->
172-284  (100812-100924)   100% ->
285-331  (101064-101110)   100% ->
332-367  (101454-101489)   100% ->
368-426  (101581-101639)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGCTGAGCTGGTTCCGGGTCCTGACAGTACTGTCCATCTGCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGCTGAGCTGGTTCCGGGTCCTGACAGTACTGTCCATCTGCCTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCGTGGCCACGGCCACGGGGGCCGAGGGCAAAAGGAAGCTGCAGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCCGTGGCCACGGCCACGGGGGCCGAGGGCAAAAGGAAGCTGCAGATCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGTCAAGAAGCGGGTGGACCACTGTCCCATCAAATCGCGCAAAGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGTCAAGAAGCGGGTGGACCACTGTCCCATCAAATCGCGCAAAGGGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCCTGCACATGCACTACACG         GGGAAGCTGGAAGATGGGAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100151 GTCCTGCACATGCACTACACGGTG...CAGGGGAAGCTGGAAGATGGGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAGTTTGACAGCAGCCTGCCCCAGAACCAGCCCTTTGTCTTCTCCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100832 AGAGTTTGACAGCAGCCTGCCCCAGAACCAGCCCTTTGTCTTCTCCCTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCACAGGCCAGGTCATCAAGGGCTGGGACCAGGGGCTGCTGGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100882 GCACAGGCCAGGTCATCAAGGGCTGGGACCAGGGGCTGCTGGGGTG...C

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    285   GATGTGTGAGGGGGAAAAGCGCAAGCTGGTGATCCCATCCGAGCTAG 
        >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101062 AGGATGTGTGAGGGGGAAAAGCGCAAGCTGGTGATCCCATCCGAGCTAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    332         GGTATGGAGAGCGGGGAGCTCCCCCAAAGATTCCAG      
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 101112 TA...CAGGGTATGGAGAGCGGGGAGCTCCCCCAAAGATTCCAGGTA...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    368    GCGGTGCAACCCTGGTGTTCGAGGTGGAGCTGCTCAAAATAGAGCGA
        >>>| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101578 CAGGTGGTGCAACCCTGGTGTTCGAGGTGGAGCTGCTCAAAATAGAGCGA

    450     .    :
    415 CGAACTGAGCTG
        ||||||||||||
 101628 CGAACTGAGCTG