seq1 = pF1KB6732.tfa, 390 bp
seq2 = pF1KB6732/gi568815597r_27566384.tfa (gi568815597r:27566384_27769314), 202931 bp

>pF1KB6732 390
>gi568815597r:27566384_27769314 (Chr1)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-148  (100780-100857)   100% ->
149-298  (100940-101089)   100% ->
299-390  (102840-102931)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGGCAGAAGGCGGTATCGCTTTTCTTGTGCTACCTGCTGCTCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGGCAGAAGGCGGTATCGCTTTTCTTGTGCTACCTGCTGCTCTTCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTGCAGTGGGGTGGAGGCAG         GTAAGAAAAAGTGCTCGGAGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 TTGCAGTGGGGTGGAGGCAGGTG...CAGGTAAGAAAAAGTGCTCGGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCTCGGACAGCGGCTCCGGGTTCTGGAAGGCCCTGACCTTCATGGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCTCGGACAGCGGCTCCGGGTTCTGGAAGGCCCTGACCTTCATGGCCGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGAGGAG         GACTCGCAGTCGCCGGGCTGCCCGCGCTGGGCTT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GGAGGAGGTG...CAGGACTCGCAGTCGCCGGGCTGCCCGCGCTGGGCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CACCGGCGCCGGCATCGCGGCCAACTCGGTGGCTGCCTCGCTGATGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100974 CACCGGCGCCGGCATCGCGGCCAACTCGGTGGCTGCCTCGCTGATGAGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGTCTGCGATCCTGAATGGGGGCGGCGTGCCCGCCGGGGGGCTAGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101024 GGTCTGCGATCCTGAATGGGGGCGGCGTGCCCGCCGGGGGGCTAGTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACGCTGCAGAGCCTCG         GGGCTGGTGGCAGCAGCGTCGTCAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101074 ACGCTGCAGAGCCTCGGTG...CAGGGGCTGGTGGCAGCAGCGTCGTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGGTAATATTGGTGCCCTGATGGGCTACGCCACCCACAAGTATCTCGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102865 AGGTAATATTGGTGCCCTGATGGGCTACGCCACCCACAAGTATCTCGATA

    400     .    :    .
    374 GTGAGGAGGATGAGGAG
        |||||||||||||||||
 102915 GTGAGGAGGATGAGGAG