seq1 = pF1KB6730.tfa, 414 bp
seq2 = pF1KB6730/gi568815582r_2922866.tfa (gi568815582r:2922866_3123941), 201076 bp

>pF1KB6730 414
>gi568815582r:2922866_3123941 (Chr16)

(complement)

1-95  (100001-100095)   100% ->
96-152  (100412-100468)   100% ->
153-281  (100581-100709)   100% ->
282-414  (100944-101076)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCCTGCAGCAGCCCTTGCAGCGAGGCCCCCAGGGAGGGGCCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCCTGCAGCAGCCCTTGCAGCGAGGCCCCCAGGGAGGGGCCCAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCCCGCGGGCCGCCTTGGGGGTGACTTGGGGCCTGGACGCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100051 CCTCCCGCGGGCCGCCTTGGGGGTGACTTGGGGCCTGGACGCCAGGTG..

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     96     CTCCCCTCTCCGAGGAGCTGTGCCCATGAGCACCAAGCGGCGCCTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 .CAGCTCCCCTCTCCGAGGAGCTGTGCCCATGAGCACCAAGCGGCGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGAGGAGCA         GGAGCCTCTGCGCAAGCAGTTTCTGTCTGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100458 GAGGAGGAGCAGTG...CAGGGAGCCTCTGCGCAAGCAGTTTCTGTCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGAGAACATGGCCACCCACTTCTCTCAACTCAGCCTGCACAATGACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100611 GGAGAACATGGCCACCCACTTCTCTCAACTCAGCCTGCACAATGACCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCTACTGCAGCCCCCCCATGACCTTCTCCCCAGCCCTGCCCCCACTCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100661 CCTACTGCAGCCCCCCCATGACCTTCTCCCCAGCCCTGCCCCCACTCAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    282         GAGCCCTTGCTCTGAGCTGCTTCTCTGGCGCTATCCTGGCAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100711 TA...TAGGAGCCCTTGCTCTGAGCTGCTTCTCTGGCGCTATCCTGGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCTCATCCCTGAGGCCCTCCGTCTGCTGAGGCTGGGGGACACCCCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100986 CCTCATCCCTGAGGCCCTCCGTCTGCTGAGGCTGGGGGACACCCCCAGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCCCCTACCCTGCAACCCCAGCTGGGGACATAATGGAGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101036 CCCCCTACCCTGCAACCCCAGCTGGGGACATAATGGAGCTC