seq1 = pF1KB6729.tfa, 276 bp
seq2 = pF1KB6729/gi568815589r_6648706.tfa (gi568815589r:6648706_6848981), 200276 bp

>pF1KB6729 276
>gi568815589r:6648706_6848981 (Chr9)

(complement)

1-276  (100001-100276)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTACCGTGGCCAGGGTCAGAAAGTGCAGAAGGTTATGGTGCAGCC
        ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATACAGTGGCCAGGGCCAGAAAGTGCAGAAGGTTATGGTGCAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCAACCTCATCTTCAGATACTTACAAAATAGATCGCGGATTCAGGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100051 CATCAACCTCATCTTCAGATACTTACAAAATAGATCGCAGATTCAGGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCTCTATGAGCAAGTGAATATGCGGATAGAAGGCTGTATCATTGGTTTT
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCTCTATGAGCAAGTGAATATGCAGATAGAAGGCTGTATCATTGGTTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGAGTATATGAACCTTGTATTAGATGATGCAGAAGAGATTCATTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100151 GATGAGTATATGAACCTTGTATTAGATGATGCAGAAGAGATTCATTCGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AACAAAGTCAAGAAAACAACTGGGTCGGATCATGCTAAAAGGAGATAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AACAAAGTCAAGAAAACAACTGGGTCGGATCATGCTAAAAGGAGATAATA

    250     .    :    .    :    .
    251 TTACTCTGCTACAAAGTGTCTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTACTCTGCTACAAAGTGTCTCCAAC