seq1 = pF1KB6724.tfa, 405 bp
seq2 = pF1KB6724/gi568815595r_139417630.tfa (gi568815595r:139417630_139639532), 221903 bp

>pF1KB6724 405
>gi568815595r:139417630_139639532 (Chr3)

(complement)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-252  (100574-100752)   100% ->
253-354  (121011-121112)   100% ->
355-405  (121853-121903)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAGTCGACTTCACTGGGTACTGGAAGATGTTGGTCAACGAGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAGTCGACTTCACTGGGTACTGGAAGATGTTGGTCAACGAGAATTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGGAGTACCTGCGCGCCCTCG         ACGTCAATGTGGCCTTGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 CGAGGAGTACCTGCGCGCCCTCGGTA...CAGACGTCAATGTGGCCTTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCAAAATCGCCAACTTGCTGAAGCCAGACAAAGAGATCGTGCAGGACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100592 GCAAAATCGCCAACTTGCTGAAGCCAGACAAAGAGATCGTGCAGGACGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACCATATGATCATCCGCACGCTGAGCACTTTTAGGAACTACATCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100642 GACCATATGATCATCCGCACGCTGAGCACTTTTAGGAACTACATCATGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTCCAGGTTGGGAAGGAGTTTGAGGAGGATCTGACAGGCATAGATGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100692 CTTCCAGGTTGGGAAGGAGTTTGAGGAGGATCTGACAGGCATAGATGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCAAGTGCATG         ACAACAGTGAGCTGGGACGGAGACAAGCTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100742 GCAAGTGCATGGTG...CAGACAACAGTGAGCTGGGACGGAGACAAGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGTGTGTGCAGAAGGGTGAGAAGGAGGGGCGTGGCTGGACCCAGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121041 CAGTGTGTGCAGAAGGGTGAGAAGGAGGGGCGTGGCTGGACCCAGTGGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGAGGGTGATGAGCTGCACCTG         GAGATGAGAGTGGAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 121091 CGAGGGTGATGAGCTGCACCTGGTA...CAGGAGATGAGAGTGGAAGGTG

    400     .    :    .    :    .    :
    374 TGGTCTGCAAGCAAGTATTCAAGAAGGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 121872 TGGTCTGCAAGCAAGTATTCAAGAAGGTGCAG