seq1 = pF1KB6719.tfa, 252 bp
seq2 = pF1KB6719/gi568815597f_153891115.tfa (gi568815597f:153891115_154091677), 200563 bp

>pF1KB6719 252
>gi568815597f:153891115_154091677 (Chr1)

1-115  (99999-100109)   96% ->
116-226  (100452-100562)   100% ->
227-252  (100951-100976)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTCTCGCAAAGGATCTCCTTCATCCCTCTCCAGAAGAGGAGAAGAG
        |-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99999 A G   CTCGCAAAGGATCTCCTTCATCCCTCTCCAGAAGAGGAGAAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100045 GAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGTGAAATGCCCAG         GATGCTATAAAATCACCACGGTCTTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100095 ATGTGAAATGCCCAGGTG...CAGGATGCTATAAAATCACCACGGTCTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCCATGCACAAACGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100478 AGCCATGCACAAACGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAG         GATGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100528 CCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGTA...CAGGATGTT

    250     .    :    .    :
    233 CCTTCAGGAGGAAGCAGCAC
        ||||||||||||||||||||
 100957 CCTTCAGGAGGAAGCAGCAC