seq1 = pF1KB6717.tfa, 252 bp
seq2 = pF1KB6717/gi568815585f_44274026.tfa (gi568815585f:44274026_44490451), 216426 bp

>pF1KB6717 252
>gi568815585f:44274026_44490451 (Chr13)

1-84  (100001-100084)   100% ->
85-157  (105616-105688)   100% ->
158-252  (116332-116426)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGCCAAACAGCGGATCCGGATGGCTAACGAGAAGCACAGCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGGCCAAACAGCGGATCCGGATGGCTAACGAGAAGCACAGCAAAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCACCCAGAGGGGGAACGTAGCCAAAACCCTG         AGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100051 CATCACCCAGAGGGGGAACGTAGCCAAAACCCTGGTA...TAGAGGCCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGAGGAGAAATATCCTGTGGGACCATGGCTGTTGGCACTGTTTGTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105623 AAGAGGAGAAATATCCTGTGGGACCATGGCTGTTGGCACTGTTTGTTTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTGTCTGTGGCTCAG         GTCAACCACATAAATTGGCCTCTCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105673 GTTGTCTGTGGCTCAGGTA...CAGGTCAACCACATAAATTGGCCTCTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGGAGACTGCCAGAACTTTCTCAAAGTTGTAACATCCAGAGGGAGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116357 TGGAGACTGCCAGAACTTTCTCAAAGTTGTAACATCCAGAGGGAGTCACC

    250     .    :    .    :
    233 CCACCCCCAAGACCGGCAAC
        ||||||||||||||||||||
 116407 CCACCCCCAAGACCGGCAAC