seq1 = pF1KB6709.tfa, 237 bp
seq2 = pF1KB6709/gi568815593r_147724664.tfa (gi568815593r:147724664_147931577), 206914 bp

>pF1KB6709 237
>gi568815593r:147724664_147931577 (Chr5)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-87  (101948-101979)   100% ->
88-194  (103450-103556)   100% ->
195-237  (106872-106914)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGTAACAGGCATCTTTCTTCTCAGTGCCTTGGCCCTGTTGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGTAACAGGCATCTTTCTTCTCAGTGCCTTGGCCCTGTTGAGTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCTG         GTAACACTGGAGCTGACTCCCTGGGAAGAGAG    
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 ATCTGGTA...TAGGTAACACTGGAGCTGACTCCCTGGGAAGAGAGGTA.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     88      GCCAAATGTTACAATGAACTTAATGGATGCACCAAGATATATGAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101984 ..TAGGCCAAATGTTACAATGAACTTAATGGATGCACCAAGATATATGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CCTGTCTGTGGGACTGATGGAAATACTTATCCCAATGAATGCGTGTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103495 CCTGTCTGTGGGACTGATGGAAATACTTATCCCAATGAATGCGTGTTATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTTTGAAAATCG         GAAACGCCAGACTTCTATCCTCATTCAAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103545 TTTTGAAAATCGGTG...CAGGAAACGCCAGACTTCTATCCTCATTCAAA

    250     .    :
    224 AATCTGGGCCTTGC
        ||||||||||||||
 106901 AATCTGGGCCTTGC