seq1 = pF1KB6708.tfa, 387 bp
seq2 = pF1KB6708/gi568815596f_97546087.tfa (gi568815596f:97546087_97748105), 202019 bp

>pF1KB6708 387
>gi568815596f:97546087_97748105 (Chr2)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-177  (100981-101054)   100% ->
178-277  (101258-101357)   100% ->
278-387  (101910-102019)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCAAGGTTACTTCGCGGAGCTGGAACGCTGGCCGCGCAGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCAAGGTTACTTCGCGGAGCTGGAACGCTGGCCGCGCAGGCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGGGCTCGCGGCCCCAGTGGCGCGGCCGCGATGCGCTCCATGGCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGGGCTCGCGGCCCCAGTGGCGCGGCCGCGATGCGCTCCATGGCATCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAG         GTGGTGTTCCCACTGATGAAGAGCAGGCGACTGGGTTG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGGTA...TAGGTGGTGTTCCCACTGATGAAGAGCAGGCGACTGGGTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGAGGGAGATCATGCTGGCTGCAAAGAAGGGACTG         GACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101019 GAGAGGGAGATCATGCTGGCTGCAAAGAAGGGACTGGTA...CAGGACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ATACAATGTACTGGCCCCAAAGGGAGCTTCAGGCACCAGGGAAGACCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101263 ATACAATGTACTGGCCCCAAAGGGAGCTTCAGGCACCAGGGAAGACCCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATTTAGTCCCCTCCATCTCCAACAAGAGAATAGTAGGCTGCATCT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101313 ATTTAGTCCCCTCCATCTCCAACAAGAGAATAGTAGGCTGCATCTGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    278     GTGAAGAGGACAATACCAGCGTCGTCTGGTTTTGGCTGCACAAAGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101363 .TAGGTGAAGAGGACAATACCAGCGTCGTCTGGTTTTGGCTGCACAAAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGAGGCCCAGCGATGCCCCCGCTGTGGAGCCCATTACAAGCTGGTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101956 CGAGGCCCAGCGATGCCCCCGCTGTGGAGCCCATTACAAGCTGGTGCCCC

    400     .    :
    374 AGCAGCTGGCACAC
        ||||||||||||||
 102006 AGCAGCTGGCACAC