seq1 = pF1KB6707.tfa, 237 bp
seq2 = pF1KB6707/gi568815589f_89211293.tfa (gi568815589f:89211293_89416422), 205130 bp

>pF1KB6707 237
>gi568815589f:89211293_89416422 (Chr9)

1-59  (100001-100059)   100% ->
60-187  (103878-104005)   100% ->
188-237  (105081-105130)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCACAAGCAGATCTACTACTCGGACAAGTACTTCGACGAACACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCACAAGCAGATCTACTACTCGGACAAGTACTTCGACGAACACTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGTACCG         GCATGTTATGTTACCCAGAGAACTTTCCAAAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGTACCGGTG...CAGGCATGTTATGTTACCCAGAGAACTTTCCAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGTACCTAAAACTCATCTGATGTCTGAAGAGGAGTGGAGGAGACTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103910 AAGTACCTAAAACTCATCTGATGTCTGAAGAGGAGTGGAGGAGACTTGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCCAACAGAGTCTAGGCTGGGTTCATTACATGATTCATGAGCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 103960 GTCCAACAGAGTCTAGGCTGGGTTCATTACATGATTCATGAGCCAGGTA.

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    188      AACCACATATTCTTCTCTTTAGACGACCTCTTCCAAAAGATCAAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104010 ..CAGAACCACATATTCTTCTCTTTAGACGACCTCTTCCAAAAGATCAAC

    250     .
    233 AAAAA
        |||||
 105126 AAAAA