seq1 = pF1KB6689.tfa, 1005 bp
seq2 = pF1KB6689/gi568815579r_43070098.tfa (gi568815579r:43070098_43305536), 235439 bp

>pF1KB6689 1005
>gi568815579r:43070098_43305536 (Chr19)

(complement)

1-64  (119132-119195)   98% ->
65-430  (120390-120755)   100% ->
431-709  (129389-129667)   99% ->
710-964  (130068-130322)   99% ->
965-1005  (135399-135439)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCACATCACCTGGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119132 ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCACATCACCTGGAAGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTCCTGCTCACAG         CATCACTTTTAAACTTCTGGAACCTGC
        | ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 119182 GCTCCTGCTCACAGGTG...TAGCATCACTTTTAAACTTCTGGAACCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTATCACTGCTCAAGTCACGATTGAAGCCCTGCCACCCAAAGTTTCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120417 CTATCACTGCTCAAGTCACGATTGAAGCCCTGCCACCCAAAGTTTCCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGAAGGATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCTCAGAATCTTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120467 GGGAAGGATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCTCAGAATCTTGCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTACATCTGGTACAAAGGACAACTGATGGACCTCTACCATTACATTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120517 CTACATCTGGTACAAAGGACAACTGATGGACCTCTACCATTACATTACAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATATGTAGTAGACGGTCAAATAAATATATATGGGCCTGCATACACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120567 CATATGTAGTAGACGGTCAAATAAATATATATGGGCCTGCATACACTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGAGAAACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120617 CGAGAAACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGAAGACGCAGGATCCTACACCTTACACATCATAAAGCGAGGTGATAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120667 GGAAGACGCAGGATCCTACACCTTACACATCATAAAGCGAGGTGATAGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCAACTTATACC         TG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 120717 CTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCAACTTATACCGTG...CAGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAACAACTCAAAACCCAGGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129391 AAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAACAACTCAAAACCCAGGGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129441 TAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129491 ACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129541 CGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AACAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGGACCGAGATGGTGGCATGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 129591 AACAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGGACCGAGATGGTGGCATGCGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GTGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCT         ATGGTCCAGACCTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 129641 GTGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTGTG...CAGATGGTCCAGACCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAAACCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130082 CCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAAACCTCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTTGTCCTGCTTCGCGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130132 CTTGTCCTGCTTCGCGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TTAATGGGAAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130182 TTAATGGGAAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 ACTACAAAGCATAGAGGGCTCTATACTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 130232 ACTACAAAGCATAGAGGGCTCTATACTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCTAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 130282 TGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGGTA...CAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CTCCTTCAGGAATAGGACGTCTTCCTCTCCTTAATCCAATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135399 CTCCTTCAGGAATAGGACGTCTTCCTCTCCTTAATCCAATA