seq1 = pF1KB6676.tfa, 1362 bp
seq2 = pF1KB6676/gi568815590f_19219548.tfa (gi568815590f:19219548_19494639), 275092 bp

>pF1KB6676 1362
>gi568815590f:19219548_19494639 (Chr8)

1-181  (100001-100181)   100% ->
182-341  (113408-113567)   100% ->
342-513  (115139-115310)   100% ->
514-594  (137656-137736)   100% ->
595-706  (141656-141767)   100% ->
707-917  (144525-144735)   100% ->
918-1048  (153983-154113)   100% ->
1049-1272  (173771-173994)   100% ->
1273-1362  (175003-175092)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGAAACAGATACTGTCGGAGATGTACATAGATCCTGATCTACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGAAACAGATACTGTCGGAGATGTACATAGATCCTGATCTACTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGCTCAGCGAAGAACAGAAACAGATCCTGTTCTTCAAGATGAGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGCTCAGCGAAGAACAGAAACAGATCCTGTTCTTCAAGATGAGAGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AACAGATCCGACGATGGAAAGAAAGAGAAGCAGCTATGGAAAGAAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AACAGATCCGACGATGGAAAGAAAGAGAAGCAGCTATGGAAAGAAAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCCTGCCAGTGAAACCCAGACCAAAGAAAG         AGAATGGCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100151 TCCCTGCCAGTGAAACCCAGACCAAAGAAAGGTA...CAGAGAATGGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATCGGTTCATTGGAAACTTGGAGCTGATAAGGAAGTCTGGGTATGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113418 ATCGGTTCATTGGAAACTTGGAGCTGATAAGGAAGTCTGGGTATGGGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGGCGAACACCATCTAGATAAACCCTATGATGTGCTCTGTAATGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113468 TGGGCGAACACCATCTAGATAAACCCTATGATGTGCTCTGTAATGAAATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATTGCTGAGAGGGCCCGGCTGAAAGCAGAACAGGAGGCAGAAGAGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113518 ATTGCTGAGAGGGCCCGGCTGAAAGCAGAACAGGAGGCAGAAGAGCCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342          AAAAACTCACTCTGAAGAATTCACCAATAGCTTGAAAACAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113568 GTA...CAGAAAAACTCACTCTGAAGAATTCACCAATAGCTTGAAAACAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AATCACAGTACCATGATCTGCAGGCTCCGGATAACCAGCAGACTAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115180 AATCACAGTACCATGATCTGCAGGCTCCGGATAACCAGCAGACTAAAGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATCTGGAAGAAAGTGGCAGAAAAGGAGGAACTGGAGCAAGGATCGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115230 ATCTGGAAGAAAGTGGCAGAAAAGGAGGAACTGGAGCAAGGATCGAGGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGCACCAACCCTGGAAGAAGAGAAAATCCGA         TCACTCTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 115280 AGCACCAACCCTGGAAGAAGAGAAAATCCGAGTG...TAGTCACTCTCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTTCTTCAAGAAATATTCAACAAATGTTGGCAGATTCAATCAATCGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137666 GTTCTTCAAGAAATATTCAACAAATGTTGGCAGATTCAATCAATCGTATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAGGCATATGCATTTCACCAG         AAGAAAGAATCTATGAAGAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 137716 AAGGCATATGCATTTCACCAGGTA...CAGAAGAAAGAATCTATGAAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AAAACAAGATGAAGAAATAAATCAAATAGAAGAAGAGAGAACGAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141676 AAAACAAGATGAAGAAATAAATCAAATAGAAGAAGAGAGAACGAAGCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTTGTAAGAGCTGGAAAGAAGACTCGGAATGGCAGGCATCTC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 141726 TTTGTAAGAGCTGGAAAGAAGACTCGGAATGGCAGGCATCTCGTG...CA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    707  TGCGAAAATCCAAAGCAGCTGATGAGAAGAGACGCTCCTTGGCTAAACA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144524 GTGCGAAAATCCAAAGCAGCTGATGAGAAGAGACGCTCCTTGGCTAAACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGCACGAGAAGACTACAAGAGGTTATCCCTCGGGGCCCAGAAAGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144574 AGCACGAGAAGACTACAAGAGGTTATCCCTCGGGGCCCAGAAAGGAAGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GCGGTGAGAGGCTGCAAAGCCCCTTGCGTGTTCCGCAGAAACCAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144624 GCGGTGAGAGGCTGCAAAGCCCCTTGCGTGTTCCGCAGAAACCAGAAAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CCTCCCCTTCCACCCAAGCCTCAGTTCCTAAACTCAGGGGCATATCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144674 CCTCCCCTTCCACCCAAGCCTCAGTTCCTAAACTCAGGGGCATATCCTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AAAACCTCTTAG         AAATCAGGGAGTGGTGAGGACACTGTCCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 144724 AAAACCTCTTAGGTA...CAGAAATCAGGGAGTGGTGAGGACACTGTCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCTCTGCCCAAGAGGACATCATCCGGTGGTTTAAAGAGGAGCAGCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154012 GCTCTGCCCAAGAGGACATCATCCGGTGGTTTAAAGAGGAGCAGCTACCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTTCGAGCGGGCTACCAGAAAACCTCAGACACCATAGCCCCCTGGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154062 CTTCGAGCGGGCTACCAGAAAACCTCAGACACCATAGCCCCCTGGTTCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TG         GAATTCTCACACTCAAGAAAGCAAATGAACTTCTTCTGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154112 TGGTG...CAGGAATTCTCACACTCAAGAAAGCAAATGAACTTCTTCTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GCACAGGCATGCCCGGCAGTTTTCTCATCCGAGTCAGTGAAAGGATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173810 GCACAGGCATGCCCGGCAGTTTTCTCATCCGAGTCAGTGAAAGGATCAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGCTATGCCCTGTCCTATCTGTCGGAGGACGGCTGTAAACATTTCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173860 GGCTATGCCCTGTCCTATCTGTCGGAGGACGGCTGTAAACATTTCCTCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CGATGCCTCTGCAGACGCCTACAGCTTCCTGGGCGTGGACCAGCTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173910 CGATGCCTCTGCAGACGCCTACAGCTTCCTGGGCGTGGACCAGCTACAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 ATGCCACCTTGGCGGATTTGGTGGAATATCACAAG         GAGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 173960 ATGCCACCTTGGCGGATTTGGTGGAATATCACAAGGTG...CAGGAGGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CCCATCACTTCCCTGGGGAAGGAGCTCCTTCTCTATCCCTGTGGTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175009 CCCATCACTTCCCTGGGGAAGGAGCTCCTTCTCTATCCCTGTGGTCAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :
   1329 GGACCAGCTGCCTGACTACCTGGAGCTGTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175059 GGACCAGCTGCCTGACTACCTGGAGCTGTTTGAG