seq1 = pF1KB6674.tfa, 1362 bp
seq2 = pF1KB6674/gi568815578r_2735465.tfa (gi568815578r:2735465_2939912), 204448 bp

>pF1KB6674 1362
>gi568815578r:2735465_2939912 (Chr20)

(complement)

1-124  (100001-100124)   100% ->
125-204  (100642-100721)   100% ->
205-443  (100831-101069)   100% ->
444-594  (101167-101317)   100% ->
595-841  (101435-101681)   100% ->
842-1117  (103599-103874)   100% ->
1118-1362  (104204-104448)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCTTCTGTCTGTCGAGCGAGGAGCCGCGCCGCCCGCTGCGAAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTCTTCTGTCTGTCGAGCGAGGAGCCGCGCCGCCCGCTGCGAAGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGGTCCACTTCCAGGCCTCGGAAGTCCAGCAGCTGCTACACAACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGGTCCACTTCCAGGCCTCGGAAGTCCAGCAGCTGCTACACAACAAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGTGGTCATCTTGGGGGACTCCA         TTCAGAGGGCTGTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100101 TCGTGGTCATCTTGGGGGACTCCAGTG...CAGTTCAGAGGGCTGTGTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGGACCTGGTGCTCTTGCTCCAGAAAGACTCACTGCTCACAGCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100659 AAGGACCTGGTGCTCTTGCTCCAGAAAGACTCACTGCTCACAGCTGCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGAAAGCCAAG         GGGGAGCTGAGCTTTGAACAGGACCAGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100709 GCTGAAAGCCAAGGTG...TAGGGGGAGCTGAGCTTTGAACAGGACCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGTGGCTGGGGGCCAGCTGGGCGAGCTGCACAACGGGACACAGTATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100859 TGGTGGCTGGGGGCCAGCTGGGCGAGCTGCACAACGGGACACAGTATCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGTCCGCCAGTTCTGCTCGGGCTCTGGCCACCACCTTGTGCGCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100909 GAGGTCCGCCAGTTCTGCTCGGGCTCTGGCCACCACCTTGTGCGCTTCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTCCTCACTCGTGTTTACTCCGAGTACCTTGAGGATGTTCTGGAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100959 CTTCCTCACTCGTGTTTACTCCGAGTACCTTGAGGATGTTCTGGAAGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGACATATGGACCTGCCCCGGACCTGGTGATCATCAACTCCTGCCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101009 TGACATATGGACCTGCCCCGGACCTGGTGATCATCAACTCCTGCCTCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GATCTCTCCAG         ATATGGTCGCTGCTCAATGGAGAGCTACCG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101059 GATCTCTCCAGGTT...CAGATATGGTCGCTGCTCAATGGAGAGCTACCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGAGAACCTGGAGCGGGTGTTTGTGCGCATGGACCAAGTATTGCCAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101197 GGAGAACCTGGAGCGGGTGTTTGTGCGCATGGACCAAGTATTGCCAGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCTGCCTGCTGGTGTGGAACATGGCGATGCCCCTCGGGGAACGTATCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101247 CCTGCCTGCTGGTGTGGAACATGGCGATGCCCCTCGGGGAACGTATCACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGGGGTTTCCTCCTGCCAGAG         CTCCAGCCCCTGGCAGGCTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101297 GGGGGTTTCCTCCTGCCAGAGGCA...TAGCTCCAGCCCCTGGCAGGCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCTGCGGCGGGATGTGGTTGAAGGGAACTTCTACAGTGCTACGCTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101455 CCTGCGGCGGGATGTGGTTGAAGGGAACTTCTACAGTGCTACGCTGGCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGGACCACTGCTTTGATGTCCTAGACCTCCACTTTCACTTCCGGCATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101505 GGGACCACTGCTTTGATGTCCTAGACCTCCACTTTCACTTCCGGCATGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTACAGCACCGTCATCGGGATGGTGTCCACTGGGACCAGCATGCACACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101555 GTACAGCACCGTCATCGGGATGGTGTCCACTGGGACCAGCATGCACACCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCACCTCTCACACCTGCTTCTGACCCATGTGGCTGACGCCTGGGGCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101605 CCACCTCTCACACCTGCTTCTGACCCATGTGGCTGACGCCTGGGGCGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGCTGCCCAAGCGTGGCTATCCCCCTG         ACCCGTGGATTGAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101655 AGCTGCCCAAGCGTGGCTATCCCCCTGGTG...TAGACCCGTGGATTGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GACTGGGCAGAGATGAATCATCCATTCCAGGGAAGCCATAGGCAGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103613 GACTGGGCAGAGATGAATCATCCATTCCAGGGAAGCCATAGGCAGACCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AGACTTCGGGGAGCACCTGGCCTTGCTCCCACCCCCACCTTCTTCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103663 AGACTTCGGGGAGCACCTGGCCTTGCTCCCACCCCCACCTTCTTCTTTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CTCCTCCCATGCCTTTTCCCTACCCGCTTCCTCAGCCCTCGCCACCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103713 CTCCTCCCATGCCTTTTCCCTACCCGCTTCCTCAGCCCTCGCCACCTCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTCTTCCCACCCCTGCCCCAGGATACCCCTTTTTTCCCAGGCCAGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103763 CTCTTCCCACCCCTGCCCCAGGATACCCCTTTTTTCCCAGGCCAGCCCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CCCACCCCATGAATTCTTCAACTATAATCCAGTGGAGGACTTCTCGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103813 CCCACCCCATGAATTCTTCAACTATAATCCAGTGGAGGACTTCTCGATGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CACCCCACTTAG         GATGTGGCCCTGGAGTGAACTTTGTGCCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103863 CACCCCACTTAGGTA...TAGGATGTGGCCCTGGAGTGAACTTTGTGCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GGCCCTCTGCCACCTCCAATCCCTGGCCCTAATCCCCATGGTCAGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104233 GGCCCTCTGCCACCTCCAATCCCTGGCCCTAATCCCCATGGTCAGCACTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GGGCCCAGTGGTCCACCGGGGGATGCCACGCTATGTTCCTAACAGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104283 GGGCCCAGTGGTCCACCGGGGGATGCCACGCTATGTTCCTAACAGCCCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 ACCATGTGCGGAGAATGGGGGGGCCCTGCAGGCAGCGGCTCAGACACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104333 ACCATGTGCGGAGAATGGGGGGGCCCTGCAGGCAGCGGCTCAGACACTCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GAGAGACTGATCCACACATACAAACTGGACAGACGGCCTCCTGCCCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104383 GAGAGACTGATCCACACATACAAACTGGACAGACGGCCTCCTGCCCATTC

   1400     .    :    .
   1347 GGGGACATGGCCTGGG
        ||||||||||||||||
 104433 GGGGACATGGCCTGGG