seq1 = pF1KB6670.tfa, 1362 bp
seq2 = pF1KB6670/gi568815579r_3859104.tfa (gi568815579r:3859104_4069735), 210632 bp

>pF1KB6670 1362
>gi568815579r:3859104_4069735 (Chr19)

(complement)

1-62  (100001-100062)   100% ->
63-423  (104745-105105)   100% ->
424-553  (105363-105492)   100% ->
554-602  (105817-105865)   100% ->
603-629  (106067-106093)   100% ->
630-782  (108575-108727)   100% ->
783-828  (109632-109677)   100% ->
829-1362  (110099-110632)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCACGTTCAGGCAGGAGGACGTGGAGGACCATTATGAGATGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCACGTTCAGGCAGGAGGACGTGGAGGACCATTATGAGATGGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCTGGGCAG         CGGCCAGTTTGCGATCGTGCGGAAGTGCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGCTGGGCAGGTG...CAGCGGCCAGTTTGCGATCGTGCGGAAGTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGCAGAAGGGCACGGGCAAGGAGTACGCAGCCAAGTTCATCAAGAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104774 GGCAGAAGGGCACGGGCAAGGAGTACGCAGCCAAGTTCATCAAGAAGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGCCTGTCATCCAGCCGGCGTGGGGTGAGCCGGGAGGAGATCGAGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104824 CGCCTGTCATCCAGCCGGCGTGGGGTGAGCCGGGAGGAGATCGAGCGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTGAACATCCTGCGGGAGATCCGGCACCCCAACATCATCACCCTGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104874 GGTGAACATCCTGCGGGAGATCCGGCACCCCAACATCATCACCCTGCACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACATCTTCGAGAACAAGACGGACGTGGTCCTCATCCTGGAGCTGGTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104924 ACATCTTCGAGAACAAGACGGACGTGGTCCTCATCCTGGAGCTGGTCTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCGGGGAGCTCTTTGACTTCCTGGCGGAGAAGGAGTCGCTGACGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104974 GGCGGGGAGCTCTTTGACTTCCTGGCGGAGAAGGAGTCGCTGACGGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGAGGCCACCCAGTTCCTCAAGCAGATCCTGGACGGCGTTCACTACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105024 CGAGGCCACCCAGTTCCTCAAGCAGATCCTGGACGGCGTTCACTACCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACTCTAAGCGCATCGCACACTTTGACCTGAAG         CCGGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 105074 ACTCTAAGCGCATCGCACACTTTGACCTGAAGGTG...CAGCCGGAAAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATCATGCTGCTGGACAAGAACGTGCCCAACCCACGAATCAAGCTCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105372 ATCATGCTGCTGGACAAGAACGTGCCCAACCCACGAATCAAGCTCATCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTCGGCATCGCGCACAAGATCGAGGCGGGGAACGAGTTCAAGAACATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105422 CTTCGGCATCGCGCACAAGATCGAGGCGGGGAACGAGTTCAAGAACATCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCGGCACCCCGGAGTTTGTGG         CCCCAGAGATTGTGAACTAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105472 TCGGCACCCCGGAGTTTGTGGGTG...CAGCCCCAGAGATTGTGAACTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAGCCGCTGGGCCTGGAGGCGGACATGTG         GAGCATCGGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 105837 GAGCCGCTGGGCCTGGAGGCGGACATGTGGTG...CAGGAGCATCGGTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CATCACCTATATCCT         CCTGAGCGGTGCATCCCCGTTCCTGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 106079 CATCACCTATATCCTGTG...CAGCCTGAGCGGTGCATCCCCGTTCCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GCGAGACCAAGCAGGAGACGCTCACCAACATCTCAGCCGTGAACTACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108601 GCGAGACCAAGCAGGAGACGCTCACCAACATCTCAGCCGTGAACTACGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTCGACGAGGAGTACTTCAGCAACACCAGCGAGCTGGCCAAGGACTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108651 TTCGACGAGGAGTACTTCAGCAACACCAGCGAGCTGGCCAAGGACTTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCGCCGGCTGCTCGTCAAAGATCCCAA         GCGGAGAATGACCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108701 TCGCCGGCTGCTCGTCAAAGATCCCAAGTA...CAGGCGGAGAATGACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTGCCCAGAGCCTGGAACATTCCTGGATTAAG         GCGATCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 109646 TTGCCCAGAGCCTGGAACATTCCTGGATTAAGGTA...TAGGCGATCCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CGGCGGAACGTGCGTGGTGAGGACAGCGGCCGCAAGCCCGAGCGGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110108 CGGCGGAACGTGCGTGGTGAGGACAGCGGCCGCAAGCCCGAGCGGCGGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCTGAAGACCACGCGTCTGAAGGAGTACACCATCAAGTCGCACTCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110158 CCTGAAGACCACGCGTCTGAAGGAGTACACCATCAAGTCGCACTCCAGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGCCGCCCAACAACAGCTACGCCGACTTCGAGCGCTTCTCCAAGGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110208 TGCCGCCCAACAACAGCTACGCCGACTTCGAGCGCTTCTCCAAGGTGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GAGGAGGCGGCGGCCGCCGAGGAGGGCCTGCGCGAGCTGCAGCGCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110258 GAGGAGGCGGCGGCCGCCGAGGAGGGCCTGCGCGAGCTGCAGCGCAGCCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GCGGCTCTGCCACGAGGACGTGGAGGCGCTGGCCGCCATCTACGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110308 GCGGCTCTGCCACGAGGACGTGGAGGCGCTGGCCGCCATCTACGAGGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGGAGGCCTGGTACCGCGAGGAGAGCGACAGCCTGGGCCAGGACCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110358 AGGAGGCCTGGTACCGCGAGGAGAGCGACAGCCTGGGCCAGGACCTGCGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AGGCTACGGCAGGAGCTGCTCAAGACCGAGGCGCTCAAGCGGCAGGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110408 AGGCTACGGCAGGAGCTGCTCAAGACCGAGGCGCTCAAGCGGCAGGCGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGAGGAGGCCAAGGGCGCGCTGCTGGGGACCAGCGGCCTCAAGCGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110458 GGAGGAGGCCAAGGGCGCGCTGCTGGGGACCAGCGGCCTCAAGCGCCGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TCAGCCGCCTGGAGAACCGCTACGAGGCGCTGGCCAAGCAAGTAGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110508 TCAGCCGCCTGGAGAACCGCTACGAGGCGCTGGCCAAGCAAGTAGCCTCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GAGATGCGCTTCGTGCAGGACCTCGTGCGCGCCCTGGAGCAGGAGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110558 GAGATGCGCTTCGTGCAGGACCTCGTGCGCGCCCTGGAGCAGGAGAAGCT

   1400     .    :    .    :    .
   1338 GCAGGGCGTGGAGTGCGGGCTGCGC
        |||||||||||||||||||||||||
 110608 GCAGGGCGTGGAGTGCGGGCTGCGC