seq1 = pF1KB6662.tfa, 1353 bp
seq2 = pF1KB6662/gi568815590r_16010088.tfa (gi568815590r:16010088_16277988), 267901 bp

>pF1KB6662 1353
>gi568815590r:16010088_16277988 (Chr8)

(complement)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-217  (102689-102802)   100% ->
218-630  (109119-109531)   100% ->
631-817  (113738-113924)   100% ->
818-898  (122845-122925)   100% ->
899-979  (127678-127758)   100% ->
980-1033  (134378-134431)   100% ->
1034-1222  (157383-157571)   99% ->
1223-1353  (167771-167901)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCAGTGGGATCACTTTCACAATCAACAGGAGGACACTGATAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCAGTGGGATCACTTTCACAATCAACAGGAGGACACTGATAGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCGAATCTGTGAAATTTGATGCTCGCTCAATGACAGCTTTGCTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCGAATCTGTGAAATTTGATGCTCGCTCAATGACAGCTTTGCTTCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGA         ATCCTAAAAACAGCCCTTCCCTTCAAGAGAAACTGAAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGAGTA...TAGATCCTAAAAACAGCCCTTCCCTTCAAGAGAAACTGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCTTCAAAGCTGCACTGATTGCCCTTTACCTCCTCGTGTTTGCAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102727 TCCTTCAAAGCTGCACTGATTGCCCTTTACCTCCTCGTGTTTGCAGTTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCCCTCTCATTGGAATAGTGGCAG         CTCAACTCCTGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102777 CATCCCTCTCATTGGAATAGTGGCAGGTA...CAGCTCAACTCCTGAAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGGAAACGAAGAATTGCTCAGTTAGTTCAACTAATGCAAATGATATAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109134 GGGAAACGAAGAATTGCTCAGTTAGTTCAACTAATGCAAATGATATAACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAAAGTCTCACGGGAAAAGGAAATGACAGCGAAGAGGAAATGAGATTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109184 CAAAGTCTCACGGGAAAAGGAAATGACAGCGAAGAGGAAATGAGATTTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGAAGTCTTTATGGAACACATGAGCAACATGGAGAAGAGAATCCAGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109234 AGAAGTCTTTATGGAACACATGAGCAACATGGAGAAGAGAATCCAGCATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTTTAGACATGGAAGCCAACCTCATGGACACAGAGCATTTCCAAAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109284 TTTTAGACATGGAAGCCAACCTCATGGACACAGAGCATTTCCAAAATTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGCATGACAACTGATCAAAGATTTAATGACATTCTTCTGCAGCTAAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109334 AGCATGACAACTGATCAAAGATTTAATGACATTCTTCTGCAGCTAAGTAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTGTTTTCCTCAGTCCAGGGACATGGGAATGCAATAGATGAAATCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109384 CTTGTTTTCCTCAGTCCAGGGACATGGGAATGCAATAGATGAAATCTCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGTCCTTAATAAGTTTGAATACCACATTGCTTGATTTGCAGCTCAACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109434 AGTCCTTAATAAGTTTGAATACCACATTGCTTGATTTGCAGCTCAACATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAAAATCTGAATGGCAAAATCCAAGAGAATACCTTCAAACAACAAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 109484 GAAAATCTGAATGGCAAAATCCAAGAGAATACCTTCAAACAACAAGAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    631        GAAATCAGTAAATTAGAGGAGCGTGTTTACAATGTATCAGCAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109534 A...CAGGAAATCAGTAAATTAGAGGAGCGTGTTTACAATGTATCAGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AAATTATGGCTATGAAAGAAGAACAAGTGCATTTGGAACAGGAAATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113781 AAATTATGGCTATGAAAGAAGAACAAGTGCATTTGGAACAGGAAATAAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GGAGAAGTGAAAGTACTGAATAACATCACTAATGATCTCAGACTGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113831 GGAGAAGTGAAAGTACTGAATAACATCACTAATGATCTCAGACTGAAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TTGGGAACATTCTCAGACCTTGAGAAATATCACTTTAATTCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 113881 TTGGGAACATTCTCAGACCTTGAGAAATATCACTTTAATTCAAGGTA...

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    818    GTCCTCCTGGACCCCCGGGTGAAAAAGGAGATCGAGGTCCCACTGGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122842 AAGGTCCTCCTGGACCCCCGGGTGAAAAAGGAGATCGAGGTCCCACTGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GAAAGTGGTCCACGAGGATTTCCAGGTCCAATAG         GTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 122892 GAAAGTGGTCCACGAGGATTTCCAGGTCCAATAGGTA...TAGGTCCTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGGTCTTAAAGGTGATCGGGGAGCAATTGGCTTTCCTGGAAGTCGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127685 GGGTCTTAAAGGTGATCGGGGAGCAATTGGCTTTCCTGGAAGTCGAGGAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TCCCAGGATATGCCGGAAGGCCAG         GAAATTCTGGACCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 127735 TCCCAGGATATGCCGGAAGGCCAGGTA...AAGGAAATTCTGGACCAAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GGCCAGAAAGGGGAAAAGGGGAGTGGAAACACATTAA         CTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 134395 GGCCAGAAAGGGGAAAAGGGGAGTGGAAACACATTAAGTA...CAGCTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ATTTACGAAAGTTCGACTGGTCGGTGGGAGCGGCCCTCACGAGGGGAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 157387 ATTTACGAAAGTTCGACTGGTCGGTGGGAGCGGCCCTCACGAGGGGAGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGGAGATACTCCACAGCGGCCAGTGGGGTACAATTTGTGACGATCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157437 TGGAGATACTCCACAGCGGCCAGTGGGGTACAATTTGTGACGATCGCTGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GAAGTGCGCGTTGGACAGGTCGTCTGTAGGAGCTTGGGATACCCAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157487 GAAGTGCGCGTTGGACAGGTCGTCTGTAGGAGCTTGGGATACCCAGGTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TCAAGCCGTGCACAAGGCAGCTCACTTTGGACAAG         GTACTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 157537 TCAAGCCGTGCACAAGGCAGCTCACTTTGGACAAGGTA...CAGGTACTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GTCCAATATGGCTGAATGAAGTGTTTTGTTTTGGGAGAGAATCATCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167777 GTCCAATATGGCTGAATGAAGTGTTTTGTTTTGGGAGAGAATCATCTATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GAAGAATGTAAAATTCGGCAATGGGGGACAAGAGCCTGTTCACATTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167827 GAAGAATGTAAAATTCGGCAATGGGGGACAAGAGCCTGTTCACATTCTGA

   1400     .    :    .    :    .
   1329 AGATGCTGGAGTCACTTGCACTTTA
        |||||||||||||||||||||||||
 167877 AGATGCTGGAGTCACTTGCACTTTA