seq1 = pF1KB6661.tfa, 1272 bp
seq2 = pF1KB6661/gi568815575r_9625749.tfa (gi568815575r:9625749_9865877), 240129 bp

>pF1KB6661 1272
>gi568815575r:9625749_9865877 (ChrX)

(complement)

1-310  (100001-100310)   100% ->
311-420  (105052-105161)   100% ->
421-515  (106452-106546)   100% ->
516-608  (117212-117304)   100% ->
609-718  (119725-119834)   100% ->
719-827  (122205-122313)   100% ->
828-945  (124423-124540)   100% ->
946-1180  (126159-126393)   100% ->
1181-1272  (140038-140129)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCAGGCAGGCCGGCGGGGTCCTGGCACACCCGAGCCGCGTCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCCAGGCAGGCCGGCGGGGTCCTGGCACACCCGAGCCGCGTCCGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACACAGCCCATGGCCTCCCCGCGCCTAGGGACCTTCTGCTGCCCCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACACAGCCCATGGCCTCCCCGCGCCTAGGGACCTTCTGCTGCCCCACGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGACGCAGCCACGCAGCTCGTGCTGAGCTTCCAGCCGCGGGCCTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGACGCAGCCACGCAGCTCGTGCTGAGCTTCCAGCCGCGGGCCTTCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGCTCTGCCTGGGCAGCGGCGGGCTCCGCTTGGCGCTGGGCCTTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGCTCTGCCTGGGCAGCGGCGGGCTCCGCTTGGCGCTGGGCCTTCTGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGCTGCCCGGCCGCCGGCCCGCGGGCCCCGGGTCCCCCGCGACGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGCTGCCCGGCCGCCGGCCCGCGGGCCCCGGGTCCCCCGCGACGTCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCCGGCCTCGGTCCGCATCCTGCGCGCTGCCGCTGCCTGCGACCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGCCGGCCTCGGTCCGCATCCTGCGCGCTGCCGCTGCCTGCGACCTTCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCTGCCTGG         GTATGGTGATCCGGTCCACCGTGTGGTTAGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCTGCCTGGGTA...TAGGTATGGTGATCCGGTCCACCGTGTGGTTAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ATTCCCAAATTTTGTTGACAGCGTCTCGGATATGAACCACACGGAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105083 ATTCCCAAATTTTGTTGACAGCGTCTCGGATATGAACCACACGGAAATTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGCCTGCTGCTTTCTGCGTGGGGAGTGCG         ATGTGGATCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 105133 GGCCTGCTGCTTTCTGCGTGGGGAGTGCGGTG...CAGATGTGGATCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTGTTGTACAGTGCCTGCTTCTGGTGGCTGTTTTGCTATGCAGTGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106464 CTGTTGTACAGTGCCTGCTTCTGGTGGCTGTTTTGCTATGCAGTGGATGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TTATCTGGTGATCCGGAGATCGGCAGGACTGAG         CACCATCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 106514 TTATCTGGTGATCCGGAGATCGGCAGGACTGAGGTA...TAGCACCATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGCTGTATCACATCATGGCGTGGGGCCTGGCCACCCTGCTCTGTGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117220 TGCTGTATCACATCATGGCGTGGGGCCTGGCCACCCTGCTCTGTGTGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGAGCCGCCATGCTCTACTACCCTTCCGTGTCCAG         GTGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 117270 GGAGCCGCCATGCTCTACTACCCTTCCGTGTCCAGGTA...CAGGTGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCGGGGCCTGGACCACGCCATCCCCCACTATGTCACCATGTACCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119731 GCGGGGCCTGGACCACGCCATCCCCCACTATGTCACCATGTACCTGCCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGCTGCTGGTTCTCGTGGCGAACCCCATCCTGTTCCAAAAGACAGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119781 TGCTGCTGGTTCTCGTGGCGAACCCCATCCTGTTCCAAAAGACAGTGACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCAG         TGGCCTCTTTACTTAAAGGAAGACAAGGCATTTACAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119831 GCAGGTA...CAGTGGCCTCTTTACTTAAAGGAAGACAAGGCATTTACAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGAGAACGAGAGGAGGATGGGAGCCGTGATCAAGATCCGATTTTTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122242 GGAGAACGAGAGGAGGATGGGAGCCGTGATCAAGATCCGATTTTTCAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCATGCTGGTTTTAATTATTTG         TTGGTTGTCGAATATCATC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 122292 TCATGCTGGTTTTAATTATTTGGTA...CAGTTGGTTGTCGAATATCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AATGAAAGCCTTTTATTCTATCTTGAGATGCAAACAGATATCAATGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124442 AATGAAAGCCTTTTATTCTATCTTGAGATGCAAACAGATATCAATGGAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TTCTTTGAAACCTGTCAGAACTGCAGCCAAGACCACATGGTTTATTATG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 124492 TTCTTTGAAACCTGTCAGAACTGCAGCCAAGACCACATGGTTTATTATGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    946         GGAATCCTGAATCCAGCCCAGGGATTTCTCTTGTCTTTGGCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124542 TA...CAGGGAATCCTGAATCCAGCCCAGGGATTTCTCTTGTCTTTGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTCTACGGCTGGACAGGATGCAGCCTGGGTTTTCAGTCTCCCAGGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126201 TTCTACGGCTGGACAGGATGCAGCCTGGGTTTTCAGTCTCCCAGGAAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GATCCAGTGGGAATCACTGACCACCTCGGCTGCTGAGGGGGCTCACCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126251 GATCCAGTGGGAATCACTGACCACCTCGGCTGCTGAGGGGGCTCACCCAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CCCCACTGATGCCCCATGAAAACCCTGCTTCCGGGAAGGTGTCTCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126301 CCCCACTGATGCCCCATGAAAACCCTGCTTCCGGGAAGGTGTCTCAAGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGTGGGCAGACTTCTGACGAAGCCCTGAGCATGCTGTCTGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 126351 GGTGGGCAGACTTCTGACGAAGCCCTGAGCATGCTGTCTGAAGGTA...C

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1181   GTTCTGATGCCAGCACAATTGAAATTCACACTGCAAGTGAATCCTGCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140036 AGGTTCTGATGCCAGCACAATTGAAATTCACACTGCAAGTGAATCCTGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ACAAAAATGAGGGTGACCCTGCTCTCCCAACCCATGGAGACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140086 ACAAAAATGAGGGTGACCCTGCTCTCCCAACCCATGGAGACCTA